任意基因的任意分组比较是生信技能树[生信爆款入门课程]TCGA数据挖掘部分提到的一个重点。为拓展课堂所学知识，现在对其做下练习巩固和总结。 1....

今天分享一篇TCGA数据挖掘（miRNA）+细胞功能实验发文思路的文章，这篇于2021年2月21日在World J Surg Oncol上发表。...

加载之前下载并保存的文件 注意：这里介绍的差异分析方法有三种，其中limma是最经典的，但是limma是必须接受log之后的值，才能正确算出差异...

热图（Heatmap）：用颜色变化直观的表达数据之间差异的图，是对实验数据进行质制和差异数据的展现，是数据挖掘类文章的标配。 例如上图，每个小方...

加载表达矩阵和生存数据 进行lasso回归，找到最佳建模位置 再用得到的最佳的位置去建模 判断预测结果的准确性 后面这段是补充，可以不用看了。。...

读取基因对应类型的数据 读取表达矩阵 把表达矩阵的中对应的lincRNA的基因挑选出来 最后 感谢jimmy的生信技能树团队！ 感谢导师岑洪老师...