综合简书作者们的文章以及自己操作，综合整理如下，以备后面使用。有问题欢迎交流Robust enumeration of cell subsets...

之前分析TCGA数据都是直接匹配barcode，其规则懂的不多。相信有不少同志也有这方面困惑。 这里给出两份资料，一份是TCGA官方英文介绍，链...

survminer包的ggsurvplot()函数可以画好看的生存分析曲线，也可以用分面的方法分面绘制多组图片（教程可以见我以前给生信助手上的一...

生存模型的构建方法包括：1. Lasso回归；2. Cox多因素回归；3. 随机森林；4. 支持向量机 可以把log_rank_test或cox...

前言 前面，我们介绍过了差异基因的功能富集分析，今天，我们对这部分的内容作一些补充 主要介绍一下 GEVA、ssGSEA 和单基因的富集分析 G...

前言 通常，在识别完了差异基因之后，都会对差异基因进行功能富集，来获取差异基因参与的潜在生物学功能通路或生物学进程，有助于理解基因之间的作用关系...

这是ggplot2可视化专题的第二个实例操作 【ggplot2的基本思路见前文总论】：基于ggplot2的RNA-seq转录组可视化：总述和分文...

estimate包可以通过RNA-seq的数据来计算标本的免疫及机制评分，进而评估肿瘤的纯度，其原理通过特征的肿瘤的RNA-seq的signtu...

任意基因的任意分组比较是生信技能树[生信爆款入门课程]TCGA数据挖掘部分提到的一个重点。为拓展课堂所学知识，现在对其做下练习巩固和总结。 1....

开门见山，直接上图 TCGA barcode 是TCGA项目中生物样本数据的主要标识符，接触过TCGA数据的人想必对这一串由数字、字母和短横线所...