公共数据库中的SRA 单细胞转录组数据究竟包含了哪些数据？CellRanger怎样利用10x平台下机数据进行下游一系列分析？这篇文章简单记录Ce...
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单细胞测序分析上游cellranger软件入门介绍 -
如何使用 Seurat 分析单细胞测序数据（ Q&A
1. 关于 QC Q：过滤线粒体基因是去除低质量 cell，核糖体基因用过滤吗？ A： Seurat 教程中没有提到用核糖体基因的 UMI 含量...
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单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程单细胞GSEA分析需要的文件有两个：1. 单细胞基因表达变化数据（两列，一列是geneid/gene symbol，一列是logFC）（文件格式...
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单细胞测序-scRNA-seq数据的标准化处理我们都知道，从数据质控开始已经进入了scRNA分析阶段，在这个阶段开始测试代码，进行实操是很重要的。测试过程中出现的各种问题可能成为你学习路上的...
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单细胞36计之7无中生有---Seurat标准教程第七计 无中生有本指本来没有却硬说有。现形容凭空捏造。 设置Seurat对象 对于本教程，我们将分析可从10X Genomics免费获得的外周血...
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Seurat官方教程 | pbmc3k_tutorial最新版Compiled: March 18, 2021 来源：https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k...
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单细胞文献-1 外周血单个核细胞的单细胞测序揭示了COVID-19和流感患者的不同免疫应答情况Single-Cell Sequencing of Peripheral Mononuclear Cells Reveals Distinct ...
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空间转录组结合单细胞转录组分析（hot）追热点，好吗？当然好，只要有足够的基金，热点还是比较容易发大文章的，但是需要注意，测序前还是应该有合理，目的明确的课题设计！（目前空间转录组测序...
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单细胞分析实录(8): 展示marker基因的4种图形（一）
今天的内容讲讲单细胞文章中经常出现的展示细胞marker的图：tsne/umap图、热图、堆叠小提琴图、气泡图，每个图我都会用两种方法绘制。 使...
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Seurat Weekly NO.09 ||UMAP图分不开怎么办？Seurat Weekly NO.0 || 开刊词[https://www.jianshu.com/p/6f88d3df702b] Seurat...
专题公告
单细胞分析
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