两个指标的相关性表示方法很多，此处介绍Cytoscape软件可视化相关性结果的步骤。这里展示基因与转录因子的相关性结果。 先看成图 步骤1.计算...
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Cytoscape可视化相关性结果 -
Cytoscape + STRING + cytoHubba 联合使用寻找hub基因今天是不用学代码利用生信软件联合“点点点”就可以取得hub基因的“白痴”实操，赶快点起来～ Hub基因（关键基因）是在生物学过程中发挥重要作用的...
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Cytoscape 3.10版软件安装插件的三个办法
Cytoscape 3.10版软件安装插件的三个办法： 使用老版本。Cytoscape 3.9版本或更低，软件自带安装商店可以正常使用，网上教程...
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在线计算lncRNA-mRNA共表达相关系数，绘共表达网络图长链非编码RNA(Long noncoding RNA)是一类长度大于200 nt，不编码蛋白质的RNA。LncRNA的功能多样，如图1所示，A...
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转录组数据分析—PPI网络构建在得到我们感兴趣的基因集后，除了对其进行GO等富集分析查看与什么重要的生物学通路相关，还可以进行PPI蛋白互作网络（PPI, Protein-P...
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PPI网络实战：String+CytoScape+MCODE插件上传DEGs gene_list到String 调整分析参数 然后下载tsv文件 同时下载图片 将前两列导入到cytoscape 导入到cyto...
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STRINGdb | 交互式可视化蛋白网络互作
在STRING数据库中提交基因，获取PPI网络是比较常规的操作，包括下游使用cytoscape进行美化和hub网络的提取，但过程还是比较麻烦，本...
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Cytoscape
1. 官网 https://cytoscape.org/index.html[https://cytoscape.org/index.html]...
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2023-02-14转录组-构建TF与DGEs的网络关系调控图我们通过转录组分析能够得到许多的差异基因，这些差异基因里包含大量的转录因子。所以，我们就想去查看转录因子与差异基因的调控关系，并将这种关系进行可...
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可视化：网络图今天继续分享生信分析中常见的图形 -- Network。网络图可以直观地展示复杂系统中各元素之间的联系，从而有助于我们发现网络的特征，揭示元...
专题公告
专注网络图构建
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