转自：生信技能树这是目前发现不错的ATAC系列，原作者在简书也有更新https://www.jianshu.com/u/d5b900bea027...
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转载ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析
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ATACseq 分析流程ATACseq 基本原理如下图所示。真核生物 DNA 与核小体结合形成染色质，结合的紧密程度是动态变化的。当 DNA 需要复制或转录时，结合变得...
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使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（四）：Merging objects
当合并多个单细胞染色质数据集时，我们必须注意到，如果每个数据集都是独立的进行peak calling，则它们得到的peaks可能不是完全一致的。...
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使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（三）：scATAC-seq data integration
在本教程中，我们将学习使用Signac包对多样本的scATAC-seq数据进行整合分析。这里，我们对来自10x Genomics和sci-ATA...
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使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（二）：Motif analysis with Signac
在本教程中，我们将学习使用Signac包进行DNA序列的motif富集分析。Signac包可以使用两种互补的方法进行motif分析：一种是通过在...
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使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（一）：Analyzing PBMC scATAC-seq
Signac是Seurat的一个扩展功能R包，可以用来分析、解释和探索单细胞染色质数据集。目前，Signac包主要专注于分析单细胞ATAC-se...
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