生物信息学 - 专题

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生物信息学

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用annovar对vcf（SNP&INDEL）文件进行注释
将原始fq文件通过FastQC-align-samtools||GATK等流程最终得到vcf文件，也就是记录某些位点变异的文本文件。但只是通过看...

0.7 sober01 3 19
RNA-seq完整分析过程
linux基本命令第六章 Linux文件与目录管理极客学院服务器高通量相关基础知识生信一百讲 1、 Anaconda Anaconda是...

12.9 热衷组培的二货潜 28 210

BSR-(RNA-seq)数据进行BSR分析
使用工具GATK4。GATK基础RNA-seq分析完整版BSR参考GATK官方RNA-seq calling流程最新版的BSR分析流程流程参考W...

0.8 wo_monic 12 12
VCF格式
刘小泽写于18.7.17所有的数据，一旦要找变异位点信息，就离不开VCF。豆豆也是在写一个重测序的操作流程，遇到了VCF文本，之前也是没有了解过...

4.4 刘小泽 2 73
一些perl的小技巧
刘小泽写于18.12.2这个周末做了不少事，参加了P4 China精准医疗会议，第一次参加这种国际性会议，长了不少见识，同时带回来很厚一摞“背景...

0.3 刘小泽 0 6
学习一点perl单行命令知识
刘小泽写于2020.3.13推荐一本书：《Perl One-liners：130 Programs That Get Things Done》P...

0.2 刘小泽 0 4 2
Linux命令行文本操作一文就够
原创：熊+jimmy+SX 生信技能树主要是awk/grep/sed这三驾马车，加上vi这个神器，最后辅助一些小工具，包括 wc,cat,di...

0.4 超级无敌大蜗牛 0 6

ggplot2高效实用指南
简介文章较长，点击直达我的博客，浏览效果更好。本文内容基本是来源于STHDA，这是一份十分详细的ggplot2使用指南，因此我将其翻译成中文，...

6.1 taoyan 7 159 1
生信blogs汇集
MOOC网站 1.学堂在线--清华大学2.华文MOOC--北京大学3.中国大学MOOC 优秀博客/网站 1.liuhui刘辉2.生信宝典文章集锦...

0.8 caokai001 0 5
Linux ${} 变量内容的提取和替换功能
1、对变量取值 2、求字符串的长度 3、提取位置3到最后的字符 4、从位置3，开始提取5个字符 5、从左边开始，删除最短匹配r 6、从左边开始，...

2.8 caokai001 0 14