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lncRNA分析
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  • bedtools intersect 的八个常用案例

    摘自“生信技能树”的《bedtools用法大全》 用来求两个BED或者BAM文件中的overlap，overlap可以进行自定义是整个genom...

    1.2 嗒嘀嗒嗒嘀嗒嘀嘀 0 8
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    STEP6:WGCNA相关性分析

    因为样本数量比较可观，所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析，挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合，或...

    12.0 六六_ryx 44 164 2
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    本周文献-181130：lncRNA

    文献信息 标题：Global identification of Arabidopsis lncRNAs reveals the regulat...

    0.8 思考问题的熊 3 12
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    LncRNA 概述

    一、lncRNA的研究背景 表观遗传学是研究基因表达发生了可遗传的改变，而DNA序列不发生改变的一门生物学分支，对细胞的生长分化及肿瘤的发生发展...

    3.0 Ray钱 0 45
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    STEP5:差异表达的mRNA和lncRNA

    很明显，得到了表达矩阵之后，根据上面的样本信息，可以按照年龄，性别，取样部位来进行分组找差异。可以参考：https://github.com/j...

    2.4 六六_ryx 7 36 1
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    「文献03」从lncRNA的角度进一步挖掘发表过的单细胞转录组测序数据

    结合单细胞测序和功能筛选揭示lncRNA H19对胚胎造血干细胞发育的关键作用 日期：2019年1月19日——2019-Week3分类：「思路」...

    2.5 六六_ryx 1 28
  • STEP9:确认LNCRNA是否真的是lncRNA

    lncRNA具有一系列独特特性，这些特性与编码蛋白质的mRNA有或多或少的区别。需要将鉴定出的新lncRNA与数据库中的lncRNA以及蛋白质编...

    0.9 六六_ryx 8 25
  • STEP8:鉴定全新的lncRNA

    这个时候已经不是表达矩阵的事情了，要从新从fastq测序数据开始。对测序后的fastq数据进行转录本的组装。基于组装后的转录本，通过数据库注释去...

    2.7 六六_ryx 21 40