每周和你一起学习一些群体遗传的知识,每周和你一起进步,欢迎回来!上一回介绍完基本的群体遗传学的概念后,这周会给大家带来一些关于等位基因和基因型频...
这周开始会陆续每周和大家分享一些和群体基因组学相关的知识(嗯,我又开始挖坑了)。本次推文先不进行具体知识的讲解,先从比较泛的角度去介绍一下群体基...
在群体遗传学研究中,LD连锁不平衡分析是最常见的分析内容,也是关联分析的基础。如何正确理解并且进行相关的LD连锁不平衡分析是群体遗传中很基本的一...
概念回顾 Fst:群体间遗传分化指数,是种群分化和遗传距离的一种衡量方法,分化指数越大,差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群分化...
Structure分析当然最经典的软件就是STRUCTURE。但Structure分析还有其他软件可以选择: ADMIXTURE、FRAPPE。...
介绍 什么是structure图? 如果你有看过群体遗传相关的文章,你对它肯定不会陌生。对那些还没有接触过的同学,那就直接上图吧: 上图是选取于...
常用的工具 PCA分析中常用的工具有GCTA中的PCA模块,老牌的软件EIGENSOFT中的smartpca,还有很多最近推出的R包都能够做PC...
PCA概念介绍 PCA 全称是Principal Component Analysis,又叫做主成分析。是一种分析、简化数据集的技术。主成分分析...
当你构建完系统进化树,你当然是想让他变得美美哒,最后是能达到发CNS的level。 下面简单给大家介绍两个比较好用的在线的进化树美化工具。 IT...
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