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BioNano以cmap格式存放光学图谱,为了评估基因组的组装质量或者了解光学图谱中冗余情况(高杂合基因组组装结果偏大),我们就需要进行cmap...
「BioNano系列」光学图谱混合组装应该怎么做? 中的第二步是非常关键的一步,因为这一步是要发现组装中的错误,提高组装的准确性。 比如说下面就...
「BioNano系列」光学图谱混合组装应该怎么做? 简单的介绍了混合组装的整体步骤,这一篇具体介绍它是如何生成hybrid scaffold表征...
在「Bionano系列」光学图谱混合组装应该怎么做?这篇文章中,我展示了下面这张图。 和之前的图不同的是,我加了几个箭头,这些箭头所指向的区域的...
评估从头组装结果 Bionano从头组装出光学图谱CMAP可以和参考序列的CMAP进行比对,通过Access上可视化检查参考基因组的组装质量,比...
官方并没有一个很详细的文档描述Bionano的从头组装流程的具体过程,所以我只能根据自己实际项目进行介绍: AutoNoise + SplitB...
从这部分开始,就开始涉及一些软件的操作和数据分析,因此在进入正文之前,我们需要准备好环境。 环境准备 第一步:从 https://bionano...
最近我拿到了一批Bionano数据,用关键字 "Bionano+组装" 进行检索时,并没有发现任何的教程,所以这应是中文网络世界里第一个Bion...
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