"Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【二】贝叶斯树的构建及基础贝叶斯分化时...

基于单体型haplotype的选择信号的检测。在selective sweeps选择过程中，有些强烈受到选择的位点variants由于LD的因素...

基础概念 Phasing，基因定相/基因分型/单倍体分型：将二倍体or多倍体基因组上的等位基因，按照其亲本正确定位到父亲or母亲的染色体上，最终...

Pophelper基本说明 群体遗传下游分析中的一项常规分析即是群体结构的分层展示(STRUCTURE ANALYSIS)，不同于系统树和PCA...

写在前面：当学习某一重要文件格式时，更需要对此格式对应软件工具进行全面的学习（如sam/bam——samtools）。在多次花时间写脚本处理文件...

当全基因组分析得到成百上千样本的变异位点vcf文件时，即可开始进行下游的一系列分析。而下游分析的首先工作，就是对得到的raw vcf文件进行筛选...

VCF格式 VCF(Variant Call Format)格式，是用于记录基因序列变异信息（gene sequence variations）...