将上游分析最后得到的counts.txt读入到R中 读入作者上传的表达矩阵GSE137675_Reads_count_featureCounts...
创建项目 下载原始FastQ数据 1.1 使用循环创建下载地址文件 1.2 编写批量下载脚本aspera.sh 1.3 运行脚本aspera.s...
题目来源:https://mp.weixin.qq.com/s/UMCNnURzw5ngeA75Wb2CeQ 现在这个数据集,有24个样本,是4...
题目来源:https://mp.weixin.qq.com/s/jzDD05M5AuhCkiavkoLiHg 使用TCGA数据库的数据对PTP4...
题目来源:https://mp.weixin.qq.com/s/jzDD05M5AuhCkiavkoLiHg 对GSE20685的所有基因做生存...
题目出自【生信技能树】公众号文章:2011年的表达芯片分析和2019年的区别要求:走GEO标准分析流程分析GSE27447 代码主要复制于Jim...
Jimmy老师今天发在群里的作业: 条带图 通路与基因之间的关系可视化 通路与通路之间的连接展示 热图展现通路与基因之间的关系
1. 读入数据: 2.表达矩阵探究 参考:RNA-seq的counts值,RPM, RPKM, FPKM, TPM 的异同 Counts值对给定...
收获: 学习了melt()和dcast()最基本的用法1)melt()得到的数据框,总行数=原数据框行数*列数,每行3个数据,分别对应原数据框每...
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