推断物种系统发育关系以及分歧时间对探讨物种起源与演化具有重要意义。通过最大似然法（ML）构建物种进化树以及估算物种分化时间在比较基因组学的研究进...

Newick Utilities是一套用于处理系统发育树的unix shell工具，其功能包括重置根（re-root）、提取子树、修剪、合并枝以...

基因组测序技术的发展使得生物序列日益增多，从大量序列数据中挖掘有用的信息成为许多研究领域的重要手段，这就使得我们必须掌握一些序列处理的方法。其中...

输入文件格式如下： 参考链接：http://theduke.at/blog/science/beginners-guide-to-creatin...

我觉得处理任何事情，不仅要做到“知其然”，还要做到“知其所以然”。在做事情时，如果仅知道低头蛮干，不知道抬头看路；只知道跟着“牵牛绳”的方向，在...

现在的社会正处于大数据时代，生物学研究领域也迎来了大组学时代。无论是植物。动物，还是微生物，都有许多物种被测序。在后续的个性化分析过程中，通常会...

系统发育树是研究物种进化历史必不可少的信息，我们可以利用它得到一些重要历史线索，如： 生物多样性（物种形成或灭绝）； 物种性状进化与多样化（Ch...