这两天“王院长”帮别人分析snv数据，顺便给我推荐了一个R包：maftools。我看了一下官网，感觉是个非常强大的R包。那必须要学习起来~实际上...

WGCNA分析过程中，你可以得到edge和node的文件，里面有你某一个module里所有基因相互之间的connectivity的weight值...

参考文章：1.甲基化芯片入门学习-ChAMP包（二）2.TCGA数据库的癌症甲基化芯片数据重分析3.TCGA甲基化芯片数据质控和过滤4.甲基化芯...

之前的文章里已经按照教程进行了TCGA数据库的一些练习（RNA-seq、芯片、生存分析），现在学习TCGA甲基化数据的分析过程。 参考文章：1....

本篇代码参考文章:1.生信菜鸟团：一文学会WGCNA分析2.WGCNA（加权基因共表达网络分析）3.WGCNA分析，简单全面的最新教程4.WGC...

根据文章生信菜鸟团：一文学会WGCNA分析所讲： WGCNA输入数据的准备，主要有两个数据需要提前准备好：（１）是表达矩阵， 如果是芯片数据，常...

如果你下载了TCGA数据库里的count数据，想把它转换成FPKM应该怎么做呢？参考文章：１．Htseq Count To Fpkm ２．【原创...

在我前面写过的如何批量下载TCGA里的数据（gdc-client方法）文章里，只涉及了如何批量下载TCGA数据，但是对于下载下来的那些文件没有整...

在分析TCGA数据库里的RNA-seq数据之前，先了解一下TCGA样本的id名称里的小秘密：参考文章：TCGA的样本id里藏着分组信息 根据文章...