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    全基因组复制分析(WGD)

    全基因组复制 全基因组复制事件是物种的染色体由于某种原因整体复制加倍的事件; 大多数被子植物都经历过多倍化事件; 物种在自然选择压力较大的时候可...

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    正选择分析

    中性理论 中性理论认为,我们今天观察到的遗传变异——无论是种内多态性还是种间分歧,均不取决于自然选择所驱动的有利突变的固定,而是取决于那些中性突...

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    jcvi(MCscan Python 版) 共线性分析

    jcvi网址:MCscan (Python version) · tanghaibao/jcvi Wiki · GitHub[https://g...

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    MCScanX共线性分析

    共线性 共线性片段是指一个同一个物种内部或者两个物种之间,由基因组复制、染色体复制、大片段复制以及物种分化而产生的大片段同源现象。同源片段内部基...

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    基因家族的收缩与扩张

    基因家族指来自诸多物种的MRCA(Most Recent Common Ancestor,最近共同祖先)的同一个始祖基因演化而来的一组基因。 研...

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    看完这篇推送的,据说都学会了分化时间计算?!

    分子钟假说 基因序列中密码子随着时间的推移以几乎恒定的比例相互替换,即具有恒定的演化速率,两个物种之间的遗传距离将与物种的分化时间成正比。我们通...

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    一文学懂进化树原理

    进化树概念 系统发育树(phylogenetic tree),也叫进化树,是物种间、基因间、群体间乃至个体间谱系关系的一种表现形式。 Node:...

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    使用ITOL美化进化树

    iTOL(Interactive Tree Of Life)是一款在线进化树美化软件,功能强大,可以展示各种数据。网址:https://itol...

  • 基于orthofinder 结果构建物种树

    串联法 orthofinder 已经生成好单拷贝基因串联的序列,可以直接使用。找到orthofinder 已经生成好单拷贝基因串联的序列,Spe...

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