科研汪的日常 21 科研中的套路与反套路

在科研界,影响因子<5分杂志期刊的常会被认为是水刊,这些杂志的发文量大,研究内容的可重复性较低。收录的研究往往只是蜻蜓点水,简单提到使用某某药物可以改善某种现象,就草草发文,而不去探究现象背后的原因。

中等水平的杂志期刊中收录的文章相较水刊的质量会高很多,如Xin Zong等人在2021年的研究中首先通过对肠上皮细胞样品进行核糖体印迹测序和m6A-seq分析,找到靶分子YTHDF1和Traf6,由后续的分子验证YTHDF1是肠上皮细胞对宿主防御细菌感染所必需的;YTHDF1通过介导Traf6转录本的翻译来调节肠上皮细胞中的免疫应答;ythdf1介导的Traf6 mRNA的翻译需要Traf6转录本的m6a甲基化;YTHDF1与Traf6转录本的结合需要DDX60;DDX60与YTHDF1作为协同调控因子,调控Traf6mRNA的翻译和下游信号转导;最后在体内实验中发现缺乏YTHDF1的小鼠有肠道免疫反应受损。由此得出结论:m6A结合蛋白YTHDF1中的P/Q/N-rich结构域与宿主因子DDX60中的DEAD结构域相互作用,从而通过识别靶标Traf6转录本来调节肠道对细菌感染的免疫应答。整个论证充分必要,也对作用机制进行了研究,总感觉少了一点点灵魂。

反观刊登在顶刊Nature上的文章,除了部分技术更先进,工作量更大等的特点,更重要的是整个故事是由浅入深,由表及里层层深入的。举例说上次分享的文献,讲的是小胶质细胞如何实现对神经元活动的负反馈调控的故事:从观察到神经元活性诱导的小胶质细胞的转录变化,小胶质细胞对神经元活动的空间控制和小胶质细胞控制着体内纹状体神经元的同步性和放电频率这些现象的观察,促使作者找到小胶质细胞通过ATP-AMP-ADO-A1R依赖反馈回路抑制神经元激活的本质,最终得出结论:突触前神经元释放的ATP被P2RY12识别,触发小胶质细胞突起的募集,随后ATP被小胶质细胞ATP/ADP水解外酶CD39转化为AMP;AMP被CD73转化为腺苷(CD73在小胶质细胞和其他脑细胞上表达),ADO作用于D1神经元上的腺苷受体A1R抑制神经元的活动。

套路在科研中终究是走不长远,真正为了追求真理与本质还得要反套路而行。


参考文献:

1. 影响因子:

https://baike.baidu.com/item/%E6%9C%9F%E5%88%8A%E5%BD%B1%E5%93%8D%E5%9B%A0%E5%AD%90/8773728?fr=aladdin

2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33999206/

3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32999463/

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 199,711评论 5 468
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 83,932评论 2 376
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 146,770评论 0 330
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 53,799评论 1 271
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 62,697评论 5 359
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,069评论 1 276
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,535评论 3 390
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,200评论 0 254
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,353评论 1 294
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,290评论 2 317
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,331评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,020评论 3 315
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,610评论 3 303
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,694评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 30,927评论 1 255
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 42,330评论 2 346
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 41,904评论 2 341

推荐阅读更多精彩内容