基础知识系列链接(节选):
CRISPR-Cas9学习笔记
Cre-LoxP条件性基因编辑系统--学习笔记
FLP-FRT系统--诱导性基因编辑inducible gene editing
系列实验链接:
CRISPR-Cas9基因敲除sgRNA设计
CRISPR-Cas9(三)--sgRNA设计好之后
CRISPR-Cas9基因敲除实验步骤 day 1
CRISPR-Cas9基因敲除实验步骤 day 2
CRISPR-Cas9基因敲除实验步骤 day 3
CRISPR-Cas9基因敲除实验步骤 day 4
这里我不再放详细的实验步骤了,因为我的实验记录本已经详细的记录了实验步骤和条件,没有多余的时间再重新弄一个,可以自行回去查找文献对照protocol
上次我的day 4做完之后,接着就要转293T细胞来验证一下质粒的效果了。简单描述以下前期的思路(其实是我自己在回顾),先准备好需要用的东西:Cas9 backbone质粒,根据基因靶点将sgRNA设计好(顺带设计一下引物),将sgRNA插入到Cas9 backone质粒中,将质粒转入感受态细胞扩增,提取质粒后酶切验证。接着就是293T细胞转染验证了。
其实就是简单的瞬时转染
使用常规的转染试剂Lipofectamine 3000或者罗氏等其他公司的转染试剂,按照protocol严格操作即可。
1. 注意293T细胞非常脆弱,动作要轻柔。
2. 但我为啥做了10天呢。。。293T细胞是非常好转的细胞,可是我仍然做了好一段时间才达到了所需的转染效率,这跟转染试剂的效率有关。尽量使用新开封的试剂。
3. 另外293T细胞的状态也很重要。
4. 细胞融合度:如果按照protocol,在转染当天70-90的细胞融合度,那就妥妥的12小时之后就长爆了,根本没法在孔板里面待够72小时。细胞一旦超过50%之后就快速增殖了,因此我选择了45%进行转染,24-48 h细胞并不是非常的满,72 h细胞还是OK的。
昨天和今天都提取了基因组DNA,就酱紫。
感谢师兄DZ