正念呼吸法可以协调理性和感性的冲突
持续正念3个月以上的实践者的脑内，前额叶和杏仁核不再是上下关系，而是会形成更为正向的对等关系。
前额叶对应负责人类的理性部位；杏仁核就对应负责感性的部位。
当受到一定的外部刺激后，杏仁核就会引发不安或愤怒的情绪；对于这种情况，通常会由理性的前额叶下达指令，试图抑制感性的杏仁核并使其镇静下来。
如果杏仁核过度活跃且已达到前额叶无法抑制的程度，交感神经作用便会引发心悸或过度呼吸等身体症状。
但是，对于经过正念训练的大脑，其前额叶与杏仁核的上下关系本身发生了变化，不再是前额叶由上而下地传达指令抑制杏仁核，而是两者取得了更为对等的平衡，两者处于相互协调的状态。
