ABcompartment和TAD主要采用cworld 软件进行分析。
Cworld 软件架构如下:
Cworld软件安装
https://github.com/dekkerlab/cworld-dekker
安装cworld 需要安装以下包:
步骤如下:
conda config --set always_yes yes --set changeps1 no
conda env create --name cworld --file cworld_environment.yml
conda clean --tarballs --index-cache --lock
source activate cworld
perl -MGD -e 'print $GD::VERSION ."\n";'