linux环境下的软件安装
将miniconda下载到服务器上
- miniconda 清华
- 查看服务器多少位 uname -a
- 安装最新版本
- 复制下载链接 链接
- 登录服务器，进入biosoft
cd biosoft
wget 链接
怎么安装miniconda
- bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
- 激活
source ~/.bashrc - 输入conda 出现满屏信息说明成功
- 添加镜像
使用中科大的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
使用conda
- 查看服务器上安装的所有软件列表 conda list
- 安装软件 conda install fastqc -y
- 确认fastqc软件是否安装成功 fastqc --help
- 卸载软件 conda remove fastqc -y
