linux环境下的软件安装
1.了解什么是conda (linux 下的应用商店)
2.给自己的服务器下载miniconda
百度搜索miniconda清华 找到对应版本的miniconda(uname-a 查看服务器位数)
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
3.安装和配置miniconda
安装miniconda
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
安装完成后激活miniconda
echo export PATH=/home/PATH>>~/.bashrc
source ~/.bashrc
添加中科大镜像 (加快下载速度)
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
使用conda下载软件
下载fastqc
conda install fastqc -y
确认fastqc软件是否安装成功
fastqc --help
卸载软件
conda remove fastqc -y