张治中把这个任务交给了孙元良，孙元良思考再三，决定派一个加强营坚守苏州北岸，而得到这个任务的，88师226旅524团，团附谢晋元，手下一共四百一十人，号称八百人，死守四行仓库。
四行仓库位于闸北，是上海四大银行的联合仓库，墙厚楼高，易守难攻，此时四行仓库的西面和北面已经被日本占领，南面和东面则是苏州河，河对面便是公共租地，与外界完全失去了联系，成为了一座孤岛，他们不知道的是，当时的四行仓库，已经成为了中国在上海的唯一一处阵地。
日军很快就包围了四号仓库，谢晋元利用仓库的优势，居高临下，大片大片的杀伤日军，日军却无可奈何，期间公共租借内的英军想要调停，让谢晋元投降，被谢晋元拒绝，英军对于四行勇士十分钦佩，称之为勇敢的中国敢死队。
中国军人在四行仓库的坚守，让租界之内的国人十分振奋，早晚都有数万人在苏州河对面围观，爱国人士杨慧敏不惜冒着生命危险，夜游苏州河，为谢晋元送来国旗一面，象征着尊严和荣耀的国旗在四行仓库上空冉冉升起，租界内国人高呼中华民族万岁。
谢晋元的种种举动，惹怒了日本人，日本为了拔掉这颗钉子，可谓是不择手段，先是想用坦克撞击仓库底座，不料敢死队员陈树生身绑炸药包从六棱一跃而下，与坦克同归于尽，不久又使用平射炮，炮击四平仓库，密集时，竟然达到一秒一发，但是四行仓库墙体厚实，炮弹也打不垮，之后日本人又使用了毒气弹，火烧，烟熏等各种方式，八百勇士死战不退，始终无一人投降。
在四行仓库不远处有两个巨大的煤气罐,万一日军恼羞成怒，将煤气罐打爆，半个上海便会化为灰烬，因此公共租界多次致电国民政府，要求谢晋元撤出四行仓库，军令下达，谢晋元只能是含泪撤出，四百壮士以弹丸之地，守住数万日军，激战四个昼夜，毙敌二百余人，自己仅仅阵亡九人，伤二十余人，取得了军事上，道义上，精神上的胜利。
四行勇士之结局——
英国方面答应负责孤军的车队，孤军可由租界至沪西然后归队，不料孤军在进入租界之时，马上被英军勒令收缴了武器，被谢晋元拒绝，双方对峙，国民党派人劝说谢晋元配合英军，可孤军的枪刚刚交出去，英军就将孤军押上车辆，送胶州路羁押，英国人之所以所以食言，因为他们也害怕日本人，日军当时对于谢晋元是恨之入骨，誓杀之而后快，日本方面威胁英租借，如果谢晋元走你们的租借撤退，日军将进入租界拿人，英国人迫于日本人的压力，收缴了孤军的装备，不让他们归队，但是为保持大英帝国的尊严，拒绝了日本人的引渡要求。
谢晋元四百勇士随后被押到了胶州路羁押，这里实际上就是租界内收容和羁押难民的地方，由于国军已经完全撤出了上海，谢晋元完全成为了孤军，但是因为日本已经将上海除租界之外全部占领，孤军真正成为了孤军，不过迫于英国人的武力，日本人倒也是不敢直接到英租借拿人。
谢晋元将难民营实行军事化管理，因为没有军饷，谢晋元便带领难民自己种菜，生产，制造肥皂，勉强可以过活，还组建了篮球队，还要求英国当局送来一面国旗，每天进行升旗，英国人迫于谢晋元强大的影响力，也答应了，不过要把旗杆削短，后来因为围观的群众越来越多，便派白俄雇佣兵抢夺国旗，双方冲突，四名勇士被打死，谢晋元也被抓，在国共联合抗议下才被释放，最终每天早晨谢晋元面对没有国旗的旗杆进行精神升旗。
当时的上海伪市长，叛徒陈公博也多次劝降谢晋元，并且委任谢晋元为第一方面军司令，委任状被谢晋元撕得粉碎，大骂陈公博。日伪对谢晋元逐渐起了杀心，1941年4月24日，日伪收买了难民营里的四名叛徒，在早操时趁谢晋元不备出手偷袭，用铁锹，砍刀将谢晋元将军打死，副官上官志标为了救助谢晋元也被砍成重伤。
1941年太平洋战争爆发，日英成为对立国，日本全面接受了英国的上海租借，因为孤军的影响力太大，决定将他们分批关押，1942年8月70名孤军被抽调到南京明孝陵做工，8人逃脱，1942年底，100多名孤军被派往安徽装卸煤炭，29人逃脱，后被国军当局要求入伍，被拒绝，于是解甲归田，1943年初，在南京明孝陵做工孤军又逃出28人，部分在茅山参加了当地的新四军，1946年3月，36名远赴巴布亚新几内亚的孤军，在历经了三年多的海外苦役之后，回到了上海，加强营营长杨瑞符在四行仓库撤退的途中，重伤后被送到重庆，不治牺牲。
上海沦陷，南京屏障已经完全失守，11月15日，蒋介石下令迁都重庆，17日开始，国民党政府要员开始分批向重庆撤退撤退一直维持了一个月的时间，而蒋介石于12月7日凌晨5点，召开最后一次南京保卫战之后，乘坐飞机离开了南京，由于蒋介石撤退的命令下的过于仓促，日本机械化追击的速度又非常快，导致撤退变成了一场大溃败，可以说历经三个多月的淞沪会战，最终是以国军的大溃败而告终的。日军自上海，到南京300多公里的路程，几乎没有遭到像样的抵抗，最终于11月底，日寇兵临南京城下。
此时守卫南京的是南京卫戍司令官唐生智，以及手下11万将士，将领有宋希濂，孙元良，俞济时，王敬久，罗卓英，萧山令，王耀武，等等，国难已经到勒如此危机的时刻，蒋介石还在打着自己的算盘，淞沪会战80万国军精锐都抵挡不住日寇进犯上海，更不要提唐生智这11万杂牌军，因为唐生智堪称是老将克星，中原大战的时候，唐生智三次反蒋，最终逼蒋介石下野，可以说蒋介石对唐生智是带着怨恨的，蒋介石也想以日本人，消灭这股反对自己的势力。
在蒋介石召集手下诸将领问出是否留守部队保卫南京之时，李宗仁，白崇禧皆从军事角度出发，不建议保卫南京，但是唐生智挺身而出，并说，没有命令绝不后撤，誓与南京共存亡。
松井石根先是诱降唐生智，被唐生智拒绝，12月7日，也就是在蒋介石离开南京的脚前脚后，日军开始于南京外围的俞济时第74军，宋希濂第36师交火，二人支撑了两天一夜，最终不敌，撤入南京城内，随后中日在南京城内的燕子矶，雨花台，四个大门展开激烈战斗，11日，军队伤亡惨重，已不堪再战，当夜，顾祝同打电话要求唐生智撤退，唐生智与罗卓英，刘兴两名副手商议过后，决定暂时压下顾祝同撤退命令，再守三天，于14日撤退。
12日，日军占领雨花台，第72军军长孙元良违抗命令，擅自率部擅自渡江撤离，被宋希濂机枪劝阻，不得不再次返回阵地，12日下午五点，鉴于日军攻势猛烈，且占领到了多出重要阵地，唐生智自觉再守也无用，于是询问众将领能否再守，众将领无一答话，唐生智遂下达了蒋介石的撤退指令，但是唐生智的这份指令，却下的模棱两可，一方面要求87师王敬久，88师宋希濂，78师俞济时于正面突围，另一方面又说如果这三军战事不利，也可渡江突围，这道命令师南京撤退时极度混乱的导火索。
唐生智下达命令之时，孙元良第一个跑了，躲在一青楼之中，化妆成难民，混出城外，72军部下还不知道撤退指令，群龙无首，瞬间被击溃，负责正面突围的王敬久及其下辖师长沈发藻在正面战场一枪不发，连部队都不去了，只是打了个电话给部队要求撤退，然后自己撒丫子跑了，教导总队大队长桂永清及其第2旅旅长胡启儒连电话都没打，也跑了，前线部队大溃败，正面战场突围不出，便一股脑与后撤部队涌入下关渡口，难民也如潮水般涌出南京城，教导总队第1 旅，第2团团长谢承瑞，在光华门死守日寇，是当时南京仅存的几个还在国军手中的出口，不料难民溃兵太多，无法有秩序撤离，被火烧伤的谢承瑞团长被滚滚洪流给踩死了，难民溃兵涌入渡口，发现渡口本来船就少，难民，溃兵为争夺船只大打出手，场面极度混乱。
孙元良的五儿子，就是著名影星秦汉，秦汉本名孙祥钟。
不过倒也不是所有军国都如孙元良，王敬久之类贪生怕死，宪兵总司令萧山令就誓与南京共存亡，在多次被部下强行推到筏子上，萧山令都从筏子跳下，与日寇战至最后时刻，直至弹尽粮绝，萧山令不甘心当俘虏，自杀殉国。南京保卫战中，一共牺牲了13位将军，镇守南京的11万将士，最终成功突出重围的只有2万多人。
12月14日，南京沦陷，随后便是维持了四十多天，震惊海外的南京大屠杀。
南京大屠杀太过于压抑和惨烈，在这里就不写了，建议看一下张纯如先生的书。
