一、三种安装方式
（一）直接输入代码安装（推荐）
1、CRAN包
1、在CRAN官网列表找到包名。
2、安装单个包，输入如下命令：
install.packages('包名')
以ggplot2为例：
install.packages('ggplot2')
3、如果安装多个包，输入如下命令，其他类比安装单个包：
install.packages(c('包名1','包名2','包名3'))
2、Bioconductor包
1、安装BiocManager。3.13为当时最新版本号，需要根据Bioconductor官网的发布更改。
if (!requireNamespace('BiocManager', quietly=TRUE))
install.packages('BiocManager')
BiocManager::install(version='3.13')
2、提示更新，输入a。
3、安装完成，下载路径见最后一行，一般在C盘，可以把压缩文件删除或者另存。
4、在官网列表找到包名。
5、安装单个包，输入如下命令：
if (!requireNamespace('BiocManager', quietly = TRUE))
install.packages('BiocManager')
BiocManager::install('包名')
以Mfuzz为例：
if (!requireNamespace('BiocManager', quietly = TRUE))
install.packages('BiocManager')
BiocManager::install('Mfuzz')
6、提示更新，输入a。安装完成。
7、如果安装多个包，输入如下命令，其他类比安装单个包：
if (!requireNamespace('BiocManager', quietly = TRUE))
install.packages('BiocManager')
BiocManager::install(c('包名1','包名2','包名3'))
（二）本地命令安装
1、下载包的压缩文件。Windows下载zip格式，Linux下载tar.gz格式。
2、输入以下命令。
install.packages('绝对路径')
如本地安装ggplot2：
install.packages('E:\R\package\ggplot2.zip')
（三）菜单栏中查找安装
1、菜单栏Tools-Install packages
2、可以选CRAN下载，也可以选本地安装。
二、加载和查看
（一）加载
#library函数：直接加载包，不管这个包是否已经被加载。
library(包名)
#require函数：如果包已经被加载，则不加载。
require(包名)
（二）查看
#查看已经安装了哪些包。
installed.packages()
#查看已经加载了哪些包。
(.packages())
#查看已安装的某个包的使用说明。
library(包名)#先加载这个包
help(package='包名')#查看帮助
#查看包的安装位置。
.libPaths()
#查看自己的电脑可以安装哪些包。
available.packages()
三、卸载和备份
（一）卸载包
#注：.library为库名。
remove.packages('包名',.library)
（二）包的备份
先找到包的安装位置，进行备份。卸载重装R后用备份的Library文件夹替换掉新安装产生的Library文件夹即可。
