中国历史上多次出现“汉贼两立，王业偏安”的情况，比如东晋、南宋等等，包括在三国、南北朝、五代十国等分裂时期，每个政权都宣布自己才是华夏正统，但是在法理上来说，正统王朝只能有一个。即便南宋长期偏安一隅，但仍被视为正统王朝，那么同样是汉人流亡政权，南明为什么不是正统，而且只存在了十几年的时间呢？
第一、政治合法性不同
明末名士王夫之曾说，华夏的统治权“可禅，可继，可革，而不可使夷类间之”，指出了王朝更迭的几个方式：禅代、继承、暴力革命。禅代是改朝换代时，新朝最喜欢的方式，因为这种方式最体面，所以曹魏、西晋等等都说自己才是中华正统，因为自己的王朝是上个王朝的皇帝亲自承认的。暴力革命一般都比较危险，因为成王败寇，刘邦、朱元璋胜利了才能说自己是正统，否则就是叛贼了。而南宋、南明都属于继承的方式，即没人让给他们，他们也没有发动革命。
但是南宋与南明有一个重要的区别，即南宋赵构是宋徽宗的儿子，赵宋宗室全都被俘北上，只有他一条漏网之鱼，所以他继承大统是所有大宋子民都承认的。但南明的那些皇帝都与崇祯关系疏远，只有弘光帝是明神宗的孙子，血缘关系还比较近，勉强有称帝的资格，但说出去也不够硬气。同时，清也高举为明复仇的大旗，将明灭亡的所有责任都推到起义军身上，夺了南明的很多光彩。
第二、金与清的汉化程度不同
这一点很重要，靖康之变金国虽然取得了长江以北的中原故地，但是他们从来没有认为自己和宋朝是一路人，采用的也是政治高压政策，并没有得到士大夫阶级的支持，所以他们不得不扶植张邦昌伪政权来统治北宋遗民。
而清军入关前后的几位皇帝都已经深受儒家思想的影响，而且他们也采取怀柔政策，笼络士大夫阶级，甚至连剃发易服也是孙之獬等汉人挑起来的。
第三、领导班子差得远
如果说赵构是昏君，那么南宋只有一个赵构，但南明有很多赵构，比如弘光、隆武、绍武等人。南宋有李纲等四大名臣，岳飞等中兴四将，南明只有一个飞扬跋扈的左良玉。南宋就算腐败，但是人家有钱啊，南明则穷困潦倒还政治昏暗。总的来说，这俩政府一个得人心，一个失人心。
第四、北宋、明朝灭亡原因不同
北宋的灭亡几乎可以将全部责任推给皇帝昏庸以及金国入侵，但是明朝的灭亡除了皇帝昏庸之外还有很多原因，并且最大的外因就是农民起义。外敌入侵了，大家可以同仇敌忾，但是王朝被农民军推翻则“病在骨髓，司命之所属，无奈何也。”
自古以来老百姓都是非常容易满足的，如果有吃有喝，能够安居乐业，那么皇帝昏庸也是可以接受的，但皇帝昏庸还御民无道，那肯定就跟着有肉吃的了。
