WHAT-认识bioconda
- conda大多数软件管理
- anaconda 总管
- miniconda 负责生信（精华版）
豆花寄语：
Linux命令行中没有图形，没有窗口，没有双击，有的只是代码～
用了Linux和R语言处理数据，就再也回不去鼠标点点点的时代了
HOW- 下载/安装miniconda
- 下载 wget minconda
- 安装 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
- 激活 source ~/.bashrc
- 添加镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
HOW-使用conda
- 查看 conda list
- 安装软件 conda install fastqc -y（-y全部接受同意）/conda install fastqc=版本号 -y（安装特定版本号）
- 查看帮助 fastqc --help
- 卸载 conda remove fastqc
WHAT-conda环境
- 分析不同项目需要不同软件
- 处理不同软件的办法就是环境，互不打扰
HOW- conda 环境的使用
- conda info --envs 查看环境 *为默认环境
- 创建一个新环境 conda create -n 文件名 python=3 fastqc trimmomatic -y
- 激活新环境 conda activate rna-seq
4.退出当前环境 conda deactivate
tips：
命令得多尝试才能熟悉，多码代码
