土壤有机质在土壤肥力和植物营养中具有多方面的重要作用，在农业生产上一定要适量增加有机质的投入，减少化肥的投入量，以微生物菌肥——奥农乐、有机肥为主，增加土壤中有机质的含量，改良土壤团粒结构，为作物生长提供一个良好的土壤环境条件，形成良性循环。
土壤有机质的作用主要包括以下几个方面：
1、提供作物需要的各种养分
土壤有机质不仅是一种稳定而长效的氮源物质，而且它几乎含有作物和微生物所需要的各种营养元素。大量资料表明，我国主要土壤表土中大约80%以上的氮、20%76%的磷以有机态存在，在大多数非石灰性土壤中，有机态硫占全硫的75%95%。随着有机质的矿质化，这些养分都成为矿质盐类（如铵盐、硫酸盐、磷酸盐等），以一定的速率不断地释放出来，整个生长季供作物和微生物利用。
土壤有机质在分解过程中，还可产生多种有机酸（包括腐殖酸本身），这对土壤矿质部分的一定溶解能力，促进风化，有利于某些养分的有效化，还能络合一些多价金属离子，使之在土壤溶液中不致沉淀而增加了有效性。
2、增强土壤的保水保肥能力和缓冲性
腐殖质疏松多孔，是亲水胶体，能吸持大量水分，可以提高土壤的保水、保肥能力。腐殖质可改善了土壤渗透性，可减少水分的大量蒸发，为作物提供更多的有效水分。
腐殖质是一种含有多酸性功能团的弱酸，其盐类具有两性胶体的作用，有很强的缓冲酸碱变化的能力，增强土壤的缓冲性。
3、改善土壤的物理性质
腐殖质在土壤中主要以胶膜形式包被在矿质土粒的外表。其粘结力和粘着力都大于砂粒，施于砂土后能增加砂土的粘性，可促进团粒结构的形成，使砂土变紧，粘土变松，使土壤变得比较松软而不再结成硬块，透水、透气性好。
腐殖质是一种暗褐色的物质，撒在土表或者是与土壤充分混合后，能明显地加深土壤颜色，从而提高了土壤的吸热性，增加地温。
4、为土壤中微生物提供营养物质，增强生命活性
土壤微生物生命活动所需的能量物质和营养物质均直接和间接来自土壤有机质，腐殖质通过调节土壤的酸碱反应，促进土壤结构等物理性质的改善，为微生物提供一个良好的生存环境，反过来也促进了各种微生物对物质的转化能力。含有机质多的土壤肥力平稳而持久，不易产生作物徒长、旺长或脱肥等到现象。
5、增强作物抗逆性
腐殖酸盐的稀溶液能改变植物体内糖类代谢，促进还原糖的积累，提高细胞的渗透压，从而增强了作物的抗旱能力。黄腐酸还是某些抗旱剂的主要成分。
奥农乐中含有的高能量和功能性物质，杀菌抑菌的同时，还可以增强作物长势，增强其抗病能力。
在施基肥时一定要以有机质含量高的微生物菌肥——奥农乐、有机肥为主，配合腐殖酸，改变传统的施肥观念，从根源上解决一些土传病害及果实产量、品质低的问题。
