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主变量和关键表型的关系(单变量论证)
Fig1:主变量表达差异 主变量的组织表达差异,提示与临床因素的相关性
Fig2 & Fig3:一正一反操作之后的表型变化 体内、体外 gain of function、loss of function 机制
Fig4 :下游机制(变量间的调控关系,主变量调控了谁) 应选择跟表型的关系已知的效应变量,在逻辑上可以自圆其说的分 子或通路 你动我也动;我不动,你动也白动
Fig5:重点机制研究:分子交互作用,提出创新的直接作用机制
结合验证 位点验证
Fig6:上游或纵横嵌套 横纵嵌套 锁定到位点水平,包含分子交互背景 通过增加分子形变的细节来增加机制的层次感 上游:明星分子搭建的间接机制
Fig7:动物模型或组织证据(多角度论证) 组织:多指标联合检测、分析相关性 动物模型:打病毒操作分子,观察下游变量的调控关系
Fig8:因变量跟因变量之间的关系 上游变量是个分泌型蛋白,已知有一个特异性受体,这个变量不是 论证的主线,但是是根据抑制认识自然延伸的补充信息。 下游变量是一个抑制能调节另一个表型的分子,考虑到主变量调节 了她,补充论证一下主变量能否也调节这种表型。
药物是抑制的上游分子的靶向抑制剂,补充验证该药是不是对阻断 你研究的这条效应通路有效
论证层次----三元分子交互的核心论证规律(至少有两组二元交互)
三元交互的5种类型
1.DNA-RNA-蛋白
2.DNA-蛋白-蛋白
3.RNA-蛋白-蛋白
RNA可以为调控对象,也可以以其中一个蛋白为效应变量 另外两个变量自然一个是主变量、一个是交互变量
4.RNA-RNA-蛋白
主变量是RAN时,一般是指lncRNA 效应变量是RNA时,一般是编码基因的mRNA
5.蛋白-蛋白-蛋白
谁是效应变量 交互变量和效应变量合二为一 效应变量就是被调控的对象 有DNA参与的三元交互,DNA必然是效应变量 效应变量一定是大明星,跟表型关系铁证如山
论证规范
层次1:二元交互两两分组论证 如蛋白-蛋白-DNA拆成蛋白-蛋白(20策左右逢源)和蛋白DNA(16策秉轴持钧)
层次2:论证二元交互作用的必要性/功能(二元交互对三元中的那个效 应变量的影响) 阐明二元交互关系对于效应变量变化的必要性阐述清楚
层次3:三元交互的必要性 阻断一个变量看另外两个变量还结合不 阻断一个变量看第二个变量对第三个效应变量的调控作用还存在不
简化原则
围绕主变量的二元关系才是论证重点、非做不可,其他部分可以适当省 略。 在三元交互分子嵌套中直接引入一组已知的二元交互关系,从而大大减 轻工作论证的工作量