庄子认为人在肉体之外一定有个什么存在的。人有肉体，可以清清楚楚看到。除了肉体我们还有的这个不知道是什么的东西。我们估且叫它灵魂。灵魂存在于哪里？下面这几段是庄子对灵魂的思考。
庄子说灵魂与肉体互为彼此的关系。没有它就没有我，没有我它也无从呈现。不知肉体与灵魂谁主宰谁。好像是有个主宰，但是证明不了。是啊，就算现在的也证明不了灵魂的存在，何况两千多年前。虽然看不见这个主宰，但是看不到证明不了的东西不代表不存在啊。人体的所有五脏六腑都在那里，这个主宰肉体的灵魂到底在哪？还是哪个器官里都存有呢？如果这些器官好似“我”所有的臣妾，她们可以运作好这个“我”吗？还是这些器官轮流做主呢？其实是有个“真君”存在的，无论我们找得到找不到，这都不影响它是真实存在的。
看庄子思考问题不同我们非黑即白。我们可以看到肉体那肉体就存在，我们看不到灵魂那灵魂就不存在。红外线、电磁场、宇宙射线我们都看不到，但现在科学证明是存在的。所以看不到不能当作存在与否的标准。当我们遇到两个对立立场的问题时也可以想到答案不一定就是其中之一。在它们之上会有个更高明的意见，可以统合这两者的意见。
