推荐一份生物信息学、群体遗传学入门学习的参考资料

在线链接

https://wurmlab.github.io/genomicscourse/2016-SIB/practicals/

image.png

主要内容

image.png

• 二代测序数据清洗
• 基因组组装
• 组装质量评估
• 基因预测
• 检查注释质量

种群基因组相关的内容

• 序列比对
• 变异检测
• 变异检测结果可视化
• 主成分分析
• 评估种群差异和多样性
• 推断种群大小和基因流

转录组数据

• 计算表达量
• 表达量聚类和差异表达分析

争取将这些内容都重复一遍，并整理笔记发布到公众号

欢迎大家关注我的公众号
小明的数据分析笔记本

• 人面猴

  序言：七十年代末，一起剥皮案震惊了整个滨河市，随后出现的几起案子，更是在滨河造成了极大的恐慌，老刑警刘岩，带你破解...

  沈念sama阅读 204,293评论 6赞 478
• 死咒

  序言：滨河连续发生了三起死亡事件，死亡现场离奇诡异，居然都是意外死亡，警方通过查阅死者的电脑和手机，发现死者居然都...

  沈念sama阅读 85,604评论 2赞 381
• 救了他两次的神仙让他今天三更去死

  文/潘晓璐 我一进店门，熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来，“玉大人，你说我怎么就摊上这事。” “怎么了？”我有些...

  开封第一讲书人阅读 150,958评论 0赞 337
• 道士缉凶录：失踪的卖姜人

  文/不坏的土叔 我叫张陵，是天一观的道长。 经常有香客问我，道长，这世上最难降的妖魔是什么？ 我笑而不...

  开封第一讲书人阅读 54,729评论 1赞 277
• 港岛之恋（遗憾婚礼）

  正文 为了忘掉前任，我火速办了婚礼，结果婚礼上，老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己，他们只是感情好，可当我...

  茶点故事阅读 63,719评论 5赞 366
• 恶毒庶女顶嫁案：这布局不是一般人想出来的

  文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着，像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上，一...

  开封第一讲书人阅读 48,630评论 1赞 281
• 城市分裂传说

  那天，我揣着相机与录音，去河边找鬼。 笑死，一个胖子当着我的面吹牛，可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播，决...

  沈念sama阅读 38,000评论 3赞 397
• 双鸳鸯连环套：你想象不到人心有多黑

  文/苍兰香墨 我猛地睁开眼，长吁一口气：“原来是场噩梦啊……” “哼！你这毒妇竟也来了？” 一声冷哼从身侧响起，我...

  开封第一讲书人阅读 36,665评论 0赞 258
• 万荣杀人案实录

  序言：老挝万荣一对情侣失踪，失踪者是张志新（化名）和其女友刘颖，没想到半个月后，有当地人在树林里发现了一具尸体，经...

  沈念sama阅读 40,909评论 1赞 299
• 护林员之死

  正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡，尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...

  茶点故事阅读 35,646评论 2赞 321
• 白月光启示录

  正文 我和宋清朗相恋三年，在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...

  茶点故事阅读 37,726评论 1赞 330
• 活死人

  序言：一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡，死状恐怖，灵堂内的尸体忽然破棺而出，到底是诈尸还是另有隐情，我是刑警宁泽，带...

  沈念sama阅读 33,400评论 4赞 321
• 日本核电站爆炸内幕

  正文 年R本政府宣布，位于F岛的核电站，受9级特大地震影响，放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜，却给世界环境...

  茶点故事阅读 38,986评论 3赞 307
• 男人毒药：我在死后第九天来索命

  文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹，春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...

  开封第一讲书人阅读 29,959评论 0赞 19
• 一桩弑父案，背后竟有这般阴谋

  文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至，却和暖如春，着一层夹袄步出监牢的瞬间，已是汗流浃背。 一阵脚步声响...

  开封第一讲书人阅读 31,197评论 1赞 260
• 情欲美人皮

  我被黑心中介骗来泰国打工， 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留，地道东北人。 一个月前我还...

  沈念sama阅读 44,996评论 2赞 349
• 代替公主和亲

  正文 我出身青楼，却偏偏与公主长得像，于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子，可洞房花烛夜当晚...

  茶点故事阅读 42,481评论 2赞 342

推荐阅读更多精彩内容

• 群体遗传学与重测序分析

  分子层面对生物的研究，在个体水平上主要是看单个基因的变化以及全转录本的变化（RNA-seq）；在对个体的研究的基础...

  研究僧小蓝哥阅读 27,527评论 10赞 144
• 群体遗传学习笔记-基础知识

  群体遗传学介绍 传统群体遗传学是基于观察到的等位基因频率与预期频率的分析。例如，在Wright-Fisher模型下...

  lakeseafly阅读 15,836评论 8赞 81
• 群体遗传学习笔记-测序技术学习

  重测序技术简介 全基因组重测序(Resequencing)是对已知参考基因组序列的物种进行不同个体间的基因组测序，...

  lakeseafly阅读 9,805评论 1赞 54
• 群体遗传学习专题一

  群体遗传学习专题 一之群体遗传所用技术 简化基因组 技术说明： 简单来说，简化基因组就是利用某种方式，获取基因组上...

  Jessica_7阅读 1,480评论 0赞 7
• 群体遗传学习专题 一

  群体遗传学习专题 一之基础知识整理 群体遗传学研究对象是生物群体，这里的群体是指孟德尔氏群体。它是由同一物种组成的...

  Jessica_7阅读 1,942评论 0赞 8