R语言基础
1、了解R和Rstudio
生信入门基础必学的就是Linux和R语言了，不过都是学习很基础的知识，简单的生信分析只需要学会怎么使用就行了。
R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数和软件包，我们可以直接进行调用，特别是它的画图功能比较强大，论文上的图都可以再R上完成。
R语言软件界面比较简单，对于我们这样的小白十分不友好，我们都用它的图形界面Rstudio，操作就简单多了。这两个我们可以直接安装在电脑上，但是在安装上也会有很多坑，全靠自己去摸索需要花费很多时间，别问我怎么知道的。就像花花说的，我们应该学会利用优质的资源，站在巨人的肩膀上，真是惨痛的教训呀。
下面就把大神写的详细的教程奉上，顺便自己再回顾梳理一下。
2、下载R和Rstudio
1）首先第一个坑就是查看你的电脑用户名是中文还是英文，如果你的用户名不幸是中文的，那就必须改为英文，否则无法安装Rstudio，或者就是安装过程中会出现很多问题。
- 如何查看和修改中文用户名
先在电脑桌面随便打开一个文件夹，点击目录所在框就会看到在Desktop前面的用户名，如果是中文就需要修改一下了。
左下角Windows搜索控制面板，找到环境变量，并点击编辑账户的环境变量
改成任何一个文件夹的路径，不带中文字符即可。新建一个文件夹，例如“D:\Rtemp”，把他填到这两个的位置即可，然后重启电脑。
参考当Rstudio杠上中文用户名
2）下载R和Rstudio
- 先参考一下大佬写的详细的下载和安装文字教程，还包括了一些基础设置和后面的高级操作
给自己一个全新的R语言环境 - 如果还是会出现问题，那就看看这个视频教程史上最贴心R包安装示范视频，看名字就知道有多详尽了吧，我也根据视频再调整了一些设置，真的恨不得早点看到这些优质的资源，这样就会节约好多时间了。
3）R语言基本操作
至于R语言的基础操作教程就很多了，跟着视频学学基础的命令就可以上手分析简单的生信项目了，不过R的最大用途还是用来画图，特别是里面的ggplot2包，功能特别强大。
下面是我学过的优质的课程视频和觉得还不错的资源，可选择学习
1、【生信技能树】生信人应该这样学R语言
2、豆豆花花的文章R数据科学--详解ggplot2
3、R语言的基础知识（R语言编程艺术）用Rproject管理工作目录
跟Linux一样，我们在进行项目分析的时候，每一个分析流程需要明确是在哪一个工作目录下，输入数据和输出数据怎么调取和爆出，所谓工作目录就是默认的读取和储存位置，也就是说，R语言只能和一个文件夹进行互动，这个文件夹非常重要，做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑，找不到。
下面这篇文章学习用Rproject管理工作目录，养成好习惯R-project管理多个R工作目录
