R包安装、卸载的多种方式

本期内容

  1. 查看及修改R包的安装路径

  2. 修改安装包的默认镜像源

  3. R包的多种安装方式

  4. R包卸载

以下如无特殊说明,命令都是在R中运行

查看及修改R包的安装路径

.libPaths() # 查看当前所有R包的安装路径
dir.create("D:/Install/R_Library") # 创建一个新路径,如果已有请忽略此步
cat('.libPaths("D:/Install/R_Library")\n', file = "~/.Rprofile", append = T) # 修改默认安装路径

重启R,再次查看安装路径,如下可以看到安装路径已修改,其实原理就是将.libPaths("D:/Install/R_Library")此行命令写入~/.Rprofile文件中,R每次启动都会自动调用

修改安装包的默认镜像源

前两期我们有提到如何配置镜像源,没有配置的小伙伴也可以输入以下命令进行配置

cat('options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))\n', file = "~/.Rprofile", append = T) # 修改默认CRAN源
cat('options(BioC_mirror = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")\n', file = "~/.Rprofile", append = T) # 修改默认BioConductor源

重启R即可生效

R包的多种安装方式

CRAN

地址:https://cran.r-project.org/web/packages/available_packages_by_name.html

注意:ubuntu下安装devtools包可能还需要先安装以下包,具体根据报错信息依次解决(看哪些依赖包没有安上,然后逐个去安装,安装上缺失的包即可),shell终端下输入以下命令:
sudo apt -y install libcurl4-openssl-dev libssl-dev libgit2-dev libxml2-dev libfontconfig1-dev libharfbuzz-dev libfribidi-dev libfreetype6-dev libpng-dev libtiff5-dev libjpeg-dev

install.packages(c("BiocManager", "devtools")) # 直接输入R包的名字即可

Bioconductor

地址:http://new.bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#___Software

library(BiocManager) # 加载BiocManager包
install("RBGL")
library(RBGL)

github

library(devtools)
install_github("js229/Vennerable")
library(Vennerable)

使用安装包安装

以安装magrittr为例,下载对应的安装包(路径:https://cran.r-project.org/src/contrib/magrittr_2.0.3.tar.gz

install.packages("E:/Temp/magrittr_2.0.3.tar.gz")
library(magrittr)

如上,安装成功,但Windows用户需要注意,这里用到了Rtools去编译C,没有安装Rtools的小伙伴请自行观看往期课程“Windows下R语言、RStudio及Rtools安装”

ubuntu下还可以直接在shell终端用命令行进行安装,如:sudo R CMD INSTALL magrittr_2.0.3.tar.gz

R包卸载

使用命令卸载

detach("package:magrittr",unload = T) # 因为刚刚有加载,先解除加载
remove.packages("magrittr")

RStudio界面操作卸载

直接在Rstudio右下窗口,Packages页面找到对应的包,点击最右边的×进行卸载

再重新加载一下这两个包,可以发现已经无法加载了,卸载成功!

最后

  1. 感谢支持,希望对您有帮助!

  2. 有不足的地方欢迎指正!

  3. 关注我们,及时获取更多干货!

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 205,236评论 6 478
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 87,867评论 2 381
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 151,715评论 0 340
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,899评论 1 278
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,895评论 5 368
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,733评论 1 283
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 38,085评论 3 399
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,722评论 0 258
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 43,025评论 1 300
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,696评论 2 323
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,816评论 1 333
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,447评论 4 322
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 39,057评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 30,009评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,254评论 1 260
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 45,204评论 2 352
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,561评论 2 343

推荐阅读更多精彩内容