siRNA转染是分子生物学常见的实验之一。在siRNA转染实验中,siRNA转染试剂的选择尤为关键,需要综合考虑转染试剂的转染性能、细胞毒性和操作方便性。目前,实验室常用的siRNA转染试剂品牌主要有赛默飞的Lipo3000、 RNAi MAX和百代生物的RFect与RFect V2。其中,RNAi MAX是国际公认的siRNA转染试剂权威产品,RFect是国产知名siRNA转染试剂,RFect V2是RFect 的最新升级产品,很多实验室反应其siRNA转染性能非常优异。RNAi MAX与RFect V2比较,各自的siRNA转染性能如何,本文拟简要叙述如下。
一、siRNA转染性能
siRNA转染性能,无疑是评价一款siRNA转染试剂实力的首要指标。不仅要看转染阳性率,更要看基因沉默效率。
RFect V2的最大突破就是专门配置了Trans Enhancer,又叫siRNA转染增强剂,可有效降低细胞膜的免疫排异反应的同时,显著提升了siRNA转染的效率,较升级前的RFect siRNA转染试剂的转染效率还可高出5-30%。那它的转染性能表现和RNAi MAX相比又如何呢?我们实验室按照两款试剂的说明书,以24孔板的推荐比例,在用于做体外质控的Hela细胞融合度达到30-50%时,分别以1.5μL的RFect V2和1.5μL的RNAi MAX转染试剂配制转染复合物进行转染,48h在荧光显微镜下观察其转染阳性率。结果显示,两者的转染阳性率都可达90以上,说明同等量的转染试剂,RFect V2与RNAi MAX的转染阳性率不相上下。
如果说转染阳性率只是一个直观的结果,并非是验证两者转染性能的“金标准”,那么还需要通过RT-qPCR来检测其基因沉默效率从而得出结论。为此,我们将能够敲降SSB基因的小干扰核酸分别通过RFect V2和RNAi MAX转染进Hela细胞,利用RT-qPCR检测转染24h后SSB的mRNA表达水平。如图所示,使用RNAi MAX转染的实验组CT值分别为21.91、21.95,使用RFect V2实验组的荧光定量检测结果相比于RNAi MAX略高出0.13-0.14个CT值,两者结果非常相近,表明RFect V2和RNAi MAX转染siRNA沉默基因的效率基本一致。
二、细胞毒性
细胞死亡率对细胞转染实验结果的影响很大,尤其是我们在研究基因沉默效率时,死亡细胞的那部分也会表现为目标mRNA表达水平的降低,因此siRNA转染试剂必须对细胞作用温和,才能实现实验结果的准确性与可靠性。
RFect V2使用了新型可降解纳米材料,和升级前的RFect相比,细胞毒性更低,并且成分上区别于以阳离子脂质体为主要成分的RNAi MAX。众所周知,siRNA转染试剂的毒性越低,其要求的转染密度也越低。在这方面,无论是RNAi MAX,还是RFect V2,都做到了转染密度在30-50%时就能取得高效的转染结果。根据我们实验室的数据,使用RNAi MAX转染Hela细胞后,细胞死亡率约为10%左右,使用RFect V2转染Hela细胞后,细胞死亡率只有5%左右,似乎还略优于RNAi MAX。可以说,RFect V2在细胞毒性方面的表现是令人惊喜的。
三、操作简便性
以研究者的角度出发,实验的简便性也十分重要。主要看两方面,一方面是需不需要特殊培养基,第二方面是需不需要换液。
特殊培养基一般是用来配制转染复合物的,因为血清的存在往往会影响转染复合物的形成,所以说必须使用减血清培养基或是无血清培养基。RNAi MAX的说明书中就已明确指出需要使用Opti-MEM减血清培养基来稀释转染试剂和siRNA,而试剂盒内并不提供这种培养基,因此实验者还需额外购买。这方面,RFect V2盒内配置有专研的转染增强剂,可完全替代无血清培养基,不仅提升了转染效率,也省去了购买特殊培养基的开支,为研究者提供了便利。
在换液问题上,研究者要根据每个转染试剂的说明书来。RFect V2不仅有很强的抗血清干扰能力,无需在转染前更换无血清培养基,而且由于对细胞毒性极低,因此也无需在转染4-6h后进行换液,换液反而可能造成转染效率降低。RNAi MAX同样在说明书中表明无需换液,但有些科研者在分享转染经验时还是建议转染后4-6小时最好更换培养液,可能对于一些敏感的细胞如果不及时更换新鲜的培养基,细胞死亡率还是比较高的。不过,对于大多数耐受性强的细胞,RNAi MAX还是有非常不错的转染效率的。因而,研究者在选择使用RNAi MAX时,可根据细胞对转染试剂的敏感度自行判断是否需要换液。
总的来说,RFect V2在各方面都有媲美RNAi MAX的性能,对于研究者来说,确实是一个不错的siRNA转染试剂新选择。