1.结构形式不同
直线职能制组织结构以直线为主，是直线式与职能制的结合。在各级行政主管之下设置相应的职能部门从事专业管理。事业部制就是按照企业所经营的事业，在总公司的领导下按产品、市场、地区等方面来划分部门，设立若干事业部。
2.适用范围不同
直线职能制在各国组织中被普遍采用，在大中型组织中尤为普遍，它被采用的时间也较长。事业部制结构主要适用于产品多元化、品种多样化，市场广阔且环境多变的公司。例如常被特大型公司和跨国公司采用。
3.运行模式不同
直线职能制中下级机构既受上级部门的管理，又受同级职能部门的指导和监督。各职能部门只是进行间接参与，只能起参谋和助理的作用，对下级机构可以进行业务指导、提出建议，但无权向下属机构及其管理人员发布命令。事业部制中每个事业部都有自己的产品和特定的市场，包揽产品从生产到销售的全部职能。事业部不是独立的法人企业，但有极大的经营自主权，独立核算、自负盈亏，在一定程度上就如同分公司一样。
4.局限性不同
直线职能制中各职能部门不重视信息之间的沟通，容易导致意见和建议的不一致甚至冲突，从而降低工作效率。若职能部门被授予的权力过大，容易干扰直线式的指挥。并且职能部门缺乏弹性，不能很好的应对环境的变化。对于事业部制而言，管理机构多，管理人员比重大，增加管理费用。在分权的形式下，各事业部有较大的自主权，容易出现脱离组织总部的问题。
以上就是我对直线职能制组织结构与事业部制组织结构的区别的一些见解。
