R语言 装包方式总结
1 普通安装(从CRAN安装)
install.packages("包名")
2 从Bioconductor安装（主要是一些生物学包）
# 先安装BiocManager包
install.packages("BiocManager")
# 再调用BiocManager包里的install函数安装
BiocManager::install("包名")
3 从GitHub上安装
3.1 方式一： devtools
# 先安装devtools包
install.packages("devtools")
# 再调用devtools包里的install_github函数安装
devtools::install_github("github用户名/包名")
3.2 方式二： remotes
# 先安装remotes包
install.packages("remotes")
# 再调用remotes包里的install_github函数安装
remotes::install_gitlab("github用户名/包名")
4 下载到本地安装
4.1 CRAN
- 从available_packages中找到并下载R包到本地
- install.packages("路径+文件名称")
install.packages("C://Users/82414/Downloads/ggplot2_3.3.5.tar.gz")
注意：还需要按照CRAN上的提示安装此包的依赖包
4.2 GitHub
- 从https://github.com/上找到并下载
- 解压并在R中打开此路径（setwd("路径名")）
- 安装
devtools::install_local()
5 conda安装
如果使用了conda环境，可以用conda的功能安装R包，还会自动的安装所需要的lib环境，相当省心。
conda install r-包名
6 常见问题总结
6.1 package ‘name’ is not available for this version of R
Warning in install.packages : package ‘Mfuzz’ is not available for this version of R
- 从CRAN上检查此包需要的R版本，如果大于您的R版本，需要升级R
- 通常情况下，一般是需要用到本文中第2或3种方法安装
7 附录
- CRAN有哪些包：
- Bioconductor有哪些包：
- anaconda查包：
