R-数据结构
- 表格在R语言中叫数据框
- 函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。
数据类型
向量
- 元素：数字或者字符串（用chr表示）等
- 标量：一个元素组成的变量
-
向量：多个元素组成的变量
1.png
<- #赋值，下一次的赋值会覆盖上一次的赋值
e.g.x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
从向量中提取元素
- 根据元素位置
e.g.
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素 - 根据值
e.g.
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素
数据框
- 将示例数据放在你的工作目录下（！！！重要）
- x<-read.csv('doudou.txt') #获得数据框
read.table(file="huahua",sep="\t",header=T) #读取本地数据 - 设置行名和列名
x<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(x) #查看列名
rownames(x) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(x)[1]<-"bioplanet" #修改左上角第一格名称，如果要修改回来，用read.table命令重新赋值一遍就可以覆盖掉刚才修改的内容
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1) #最后row.names的意思是修改第一列为行名 - 数据框的导出
write.table(x,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F) #x是数据框被赋予的变量名，分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号） - 变量的保存与重新加载
这次没有处理完的数据下次可以接着用，保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令 -
提取元素
X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列
X[y] #也是第y列
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列
R-数据类型.png
