R 包是第三方扩展包，在生物学上应用比较多的是 Biconductor 包!
1、R 包的在线安装
install.packages(“xxx”) #第一次安装 R 包，需要选择临近下载镜像站点 (CRAN mirror)，在安装包上要加双引号，不加的话，R会将其当作对象，就会报错。
显示库所在的位置
.libPaths()
显示库里的软件包
library()
一次性安装多个包
install.packages (c("a","b","c"))
更新软件包
update.packages("xxx")
2、R 包的使用
R包安装后，就不需要引号，可以直接载入使用。
library(xxx) or > require(xxx)
R 包的使用说明
help(package="xxx")
查看包的基本信息,例如数据集
library(help="xxx")
列出 R 包中包含的函数
ls("packages:xxx")
查看包的数据集
data(package="xxx")
移除加载的包
detach("package:xxx") #此处使用的是冒号
需要使用应重新加载
require(xxx)
删除已安装的 xxx 包
remove.packages("xxx")
R包的批量移植 (描述简略)
installed.packages() #列出当前环境已经安装软件
Rpack <- installed.packages() [,1] #访问数据框的第一列
save(Rpack, file="Rpack.Rdata") #将 Rpack 中的名字保存在一个文件中
载入文件，穿建一个新的变量 Rpack
for (i in Rpack) install.packages(i)
3、获取 R 包帮助文档
命令行打开 R 帮助文档
help.start() # Rstudio 中使用帮助窗口、
列出函数详细的信息
help(function name)
?function name
快速列出函数信息
args(function name)
函数示例
example()
查看包的帮助文档
help(package=ggplot2)
4、内置数据集
help(package="datasets")
