第二周:20220131-20220206
2022-1-31
今天是第二周开始的第一天,同时也是除夕,虽然是节日,但是也要坚持完成小目标。
起床后完成了30个墙式俯卧撑+10个深蹲(2/3难度)。
早餐后看了爱奇艺平台的纪录片《Big History》中的“The great divide”部分。(20分钟)
然后阅读了pubmed中“BPH resistance in rice”结果(245) 的5篇文献的摘要,并整合至pubmed中:
Liu, J Proteomics, 2021; (野生稻、Bt转基因水稻和栽培稻的褐飞虱取食后转录组合蛋白质组联合分析)
Boddupally, SR, 2018; (Cry1Ac和ASAL融合基因的转基因植株的抗虫性分析)
Tan, BMC Genomics, 2020; (BPH6转基因植株的miRNA组和转录组联合分析)
Satturu, Vaccines (Basel), 2020; (GWAS分析MAGIC群体的抗性基因位点)
Jing, COIS, 2017; (水稻-褐飞虱互作综述,何老师2篇COIS之一,值得细读)
接着读了《生物信息学》第二章中其他组学数据章节的剩下部分(5页)
洗澡前后完成了20个墙式俯卧撑+10个深蹲(2/3难度)。
由于今天是过年,为了守岁,今晚没有阅读文献。
2022-2-1
今天是虎年的第一天,早上给各位亲朋好友和老师送上新年祝福,然后陪家人娱乐了下,因此中午才开始今天的小目标计划。
首先观看了爱奇艺平台的纪录片《Big History》中的“Caffeine”部分。(20分钟)
然后阅读了pubmed中“BPH resistance in rice”结果(245) 的5篇文献的摘要,并整合至pubmed中:
Chen, Plants, 2020; (磷酸戊糖途径基因Os6PGDH1的表达的模式以及过表达植物的褐飞虱抗性分析)
Ma, NPH, 2020; (JA和ET拮抗调控褐飞虱抗性的分子机制,植物激素调控褐飞虱抗性的重要文献)
Kang, Metabolomics, 2019; (奎奎的不同抗性品种的非靶向代谢组学分析文章,哈哈)
Ma, FIPS,2017;(水稻RLCK基因OsRKK1调控褐飞虱趋避性)
Zhang, IJMS, 2021; (水稻Ring型E3连接酶OsJMJ715副调控褐飞虱抗性,同时与激素相关)。
午餐前完成了50个墙式俯卧撑+10个深蹲(2/3难度)。
午餐后读了《生物信息学》第二章中蛋白质序列及其结构测定章节(3页),至此第二章已经读完。
晚上做了30+20+30个墙式俯卧撑+20个桌式俯卧撑+20个深蹲。
睡觉前完成COLD1讨论部分第三和第四段的阅读。
2022-2-2
今天是大年初二,早上起床后完成了50个(25+25)墙式俯卧撑+20个(10+10)桌式俯卧撑+30个(15+15)深蹲(2/3难度)。
在去给领导拜年的路上和回家路上听了九边音频的“鱿鱼游戏”和“人海战术”的两段(40分钟)。(有时间还是要看下鱿鱼游戏这部剧)
午睡后观看了爱奇艺平台的纪录片《Big History》中的“Fly”部分(20分钟)。
然后阅读了pubmed中“BPH resistance in rice”结果(245) 的5篇文献的摘要,并整合至pubmed中:
Satturu, IJBM, 2021; (6个不同褐飞虱抗性水平水稻品种的转录组分析)
Yue, JIP, 2019; (褐飞虱抗感水稻品种的代谢组分析,文庆老师组的工作)
Li, FIPS, 2019; (在水稻中过表达拟南芥NLRs RPS2和RPM1能够提高抗病抗虫性)
Hao, FIPS, 2018; (抗褐飞虱代谢物Schaftosdie与褐飞虱NlCDK1互作影响水稻对褐飞虱抗性,重要文献)
Wu, SR, 2017; (抗褐飞虱基因BPH15转基因植物的miRNA组分析)。
晚餐后读了《生物信息学》第三章分子数据库中“分子数据库及其记录格式”部分(4页)。
睡觉前精读了COLD1文章讨论部分第五和第六段的阅读。
2022-2-3
今天是大年初三,春节假期的第四天,应该由纯休息状态慢慢转入半工作状态了。
早上起床后读了《生物信息学》第三章分子数据库中“数据库序列递交及检索”部分(4页),然后完成了50个墙式俯卧撑+20个深蹲(3/4难度)。
然后阅读了pubmed中“BPH resistance in rice”结果(245) 的5篇文献的摘要,并整合至pubmed中:
Ye, IJMS, 2021; (eLRR蛋白OsI-BAK1负调控水稻应答褐飞虱胁迫,负调控因子可能会被褐飞虱利用)
Zhang, BMC PB, 2019; (3种不同抗性水平的水稻品种褐飞虱取食后的蛋白质组学分析)
Li, Rice, 2019; (来自野生稻的抗褐飞虱基因Bph36的精细以及利用MAS的育种应用)
Nguyen, Plants, 2019; (含有单个或多个抗褐飞虱基因的22个NILs的培育)
Pang, Plos Genet, 2018; (褐飞虱共生菌S-type负调控褐飞虱对杀虫剂的抗性)
接着观看了爱奇艺平台的纪录片《Big History》中的“Phone”部分(20分钟)。
拜访亲友回来后,晚餐前完成了50个墙式俯卧撑+15个桌式(儿童桌)俯卧撑+20个深蹲(3/4难度)。
又添加了pubmed中“BPH resistance in rice”结果(245) 的4篇文献的摘要,并整合至pubmed中:
Akanksha, J. Genet, 2019; (Bph39t和Bph40t的精细定位)
Gupta, J. Biomol. Struct. Dyn, 2019; (抗褐飞虱基因BPH14的结构配体计算分析,新的思路,值得深读)
Zhou, IJMS, 2019; (OsMKK3通过影响褐飞虱诱导的植物激素变化正调控水稻褐飞虱抗性)
Kumar, TAG, 2018; (抗褐飞虱基因BPH34的精细定位)
晚餐后,精读了COLD1文章讨论部分最后一段的阅读。前后花了大约2个星期,总算坚持读了这篇经典文献。虽然还有许多不理解的地方,至少是精读了一遍,不明白的地方以后还可以继续细读。同时,希望随着精读的文献越来越多,精细阅读文献的效率能够快速提高。
2022-2-4
今天是农历节气的立春,是二十四节气之首。立,是“开始”之意,春代表温暖、生长。干支纪元中,立春为岁首,寓意万物起始、一切更生,意味着新的一个轮回的开始。
为了讨个好彩头,今天是假期几天以来起床最早的一天。起床后阅读了自重健身的视频和书本,修正了锻炼中的一些错误,然后按照正确的方式完成了35+15个墙壁俯卧撑+10个折刀深蹲。在这个健身方面,不要总想一口吃成胖子,坚持按照循序渐进的升级方式进行锻炼,先坚持锻炼个一年再看效果。
吃完早餐后,观看了爱奇艺平台的纪录片《Big History》中的“Meteor”部分(20分钟),接着读了《生物信息学》第三章分子数据库中“核苷酸初级数据库”部分(4页)。
午餐前添加了pubmed中“BPH resistance in rice”结果(245) 的5篇文献的摘要,并整合至pubmed中:
Harun-Or-Rashid, FIPS, 2018; (水稻内生菌YC7010能够通过促进抗虫激素、次生代谢和细胞壁成分等三方面提高水稻对褐飞虱抗性,很不错的发现,值得学习)
Yang, SR, 2017; (硅肥的施用延缓了褐飞虱对水稻的取食及其种群世代,从而提高水稻对褐飞虱抗性)
Prahalada, Rice, 2017; (抗褐飞虱基因BPH31的精细定位)
Nguyen, Breed Sci, 2021; (PTB33品种中三个抗性基因的染色体位置界定)
Shi, FIP, 2021; (杀菌剂通过改变褐飞虱脂肪体中的共生菌菌群影响褐飞虱的存活率)
下午不慎将手机掉入床边缝中,预计要元宵后找工人拆床才能取出。刚开始对心情打击挺大,很是沮丧。经过一番心理调整以及睡觉休息后调整好了状态,不管遇到什么困难,保持积极的姿态,遇到麻烦解决问题,继续前行。
今晚没有进行阅读,一个原因是没有找到文献(计划阅读最新发表在Science上的植物与昆虫互作文章),当然主要还是懒惰,应当要将睡前阅读坚持下去,自勉!
2020-2-5
早上起床后完成了两组(35+25)墙壁俯卧撑+两组(10+10)半深蹲,这两个训练项目有根据书本进行动作修正,其中墙壁俯卧撑提高了难度,半深蹲则保证了动作的标准。
早餐后添加了pubmed中“BPH resistance in rice”结果(245) 的4篇文献的摘要,并整合至pubmed中:
Fan, FIPS, 2017; (通过分子标记辅助育种MMAS选育含有多个发育和抗虫基因的恢复系)
Sun, PMS, 2020; (氮肥浓度对BPH14介导的水稻对褐飞虱抗性的影响分析)
Pan, JXB, 2018; (BR通过协调SA和JA信号负调控水稻对褐飞虱抗性)
Senthil-Nathan, SR, 2021; (升高的二氧化碳浓度对不同褐飞虱抗性水稻品种以及褐飞虱的影响)
白天陪家人去了一方乐田游玩,也算是一种精神放松。下午回家后,读了《生物信息学》第三章分子数据库中“核苷酸二级数据库”部分(4页)。接着,观看了爱奇艺平台的纪录片《Big History》中的“Sliver”部分(20分钟)。
不知不觉,已经小目标计划已经开展接近两周了。不由感叹时光飞逝,唯有在飞逝的过程中坚持日复一锤,必然会有意想不到的收获。加油,Yangshuo, you will be great.
晚上精读了最新发表在Science上的“Nonhost resistance of herbivores”文章的Abstract部分和Introduction部分第一段。
2022-2-6
今天是春节假期的最后一天,也是小目标计划第二周的最后一天,继续坚持。
早上起床后,观看了墙壁俯卧撑示范视频,发现了墙壁俯卧撑动作中手臂和手肘发力的错误以及之前的锻炼距离问题,修正后发现难度比之前的大很多,因此需要重新练习墙壁俯卧撑(该动作是标准俯卧撑的基础动作,一定要练好,以免以后进阶后发现根基不稳,遇到瓶颈)。同时在观看深蹲的动作示范视频时,认识到还是应该从折刀深蹲或者支撑深蹲开始进行基础练习,把动作练标准,不要太快进入半深蹲或标准深蹲,同样避免根基不稳。因此,早上在做了几次纠正后训练后,完成了2组(10+10)墙壁俯卧+2组(10+10)支撑深蹲。
早餐后,观看了爱奇艺平台的纪录片《Big History》中的“Sun”部分(20分钟)。然后添加了pubmed中“BPH resistance in rice”结果(246) 的4篇文献的摘要,并整合至pubmed中:
Wang, SR, 2020; (稻飞虱取食诱导的水稻Phenolamides是一种重要的抗性代谢物)
Li, PP, 2019; (水稻MAPK激酶OsMAPK20-5负调控水稻对褐飞虱的抗性)
Zhang, JVE, 2020; (水稻抗白背飞虱表型鉴定的简易方法,值得深读)
Uawisetwathana, Phytochemistry, 2022; (不同抗性品种褐飞虱取食后的代谢组学分析,需要关注)
接着,读了《生物信息学》第三章分子数据库中“蛋白质序列与结构数据库”部分(4页)。
洗澡前后完成了2组(10+10)墙壁俯卧+2组(10+10)支撑深蹲。
睡觉前精读了最新发表在Science上的“Nonhost resistance of herbivores”文章的Introduction部分第二段。
周总结:这是第二周继续坚持小目标计划,由于刚好是春节长假,时间较为充裕,总体来说情况不错,能够每天坚持完成。下周开始就要开始上班工作,时间会变得紧张,希望能够继续坚持下去,Fighting foever!