一只弱鸡
IP属地：宁夏
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ldsc 计算速度很慢啊，一条染色体170万个SNP，计算了1天了，还没结果
LD SCore计算基因多效性、遗传度、遗传相关性(the LD Score regression intercept, heritability and genetic correlation)
这篇文章是对之前啊啊救救我，为何我的QQ图那么飘（全基因组关联分析）这篇文章的一个补坑。 LD SCore除了查看显著SNP位点对表型是否为基因多效性外，还额外补充了怎么计算...
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主要整理有关基因组分析的相关内容
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12.GWAS：候选基因挖掘
在上一步确定好候选区间后，需要找到候选区间内的基因，即候选区间和参考基因组取交集，用到的工具是bedtools。 关于bedtools的详细用法，推荐这篇文章，介绍的很详细，...
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我也是出了这个问题，但是grep 去除NaN那一行后，问题仍然存在。最后检查发现，是用awk 截取某几列后，出现未名BUG！！！
CMplot报错missing value where TRUE/FALSE needed
今天在使用CMplot画曼哈顿图时遇到一个bug：Error in if (sum(pvalueT <= 0) != 0 || sum(pvalueT > 1) != 0) ...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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不同引用格式文献导入endnote20所有格式的导入，首先菜单栏选择File——import——file 1.ris格式和ciw格式 web of science导出的endnote格式通常为ris和ciw，可以...
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3.2 GWAS：最佳线性无偏估计量——BLUE值计算（多年单点有重复）
GWAS中使用均值、BLUP值还是BLUE值，邓飞老师有两篇帖子进行了介绍，链接如下，根据我的数据，我选择了BLUE值。在这里提醒大家，不要一上来就忽略所有warning，很...
