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该程序是获得unique比对序列长度分布信息。 上面的程序无法流程化处理,可以调用python的sys来实现流程化的处理。
通常从测序公司拿到的fq文件分为四行,第一行为序列名称,第二行为序列的碱基,第三行为序列名称,通常用+号代替,第四行为碱基质量。代码如下: sh...
这里更详细。Python官方文档中文翻译Python v2.7.8 中文文档 对序列长度和名字提取之后往往是无序的,可以从以下代码来排序