近期，国内植物单细胞RNA测序相关研究再发力。2020年6月24日，河南大学孙旭武教授课题组在Molecular Plant在线发表了题为Global Dynamic Mol...
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国内植物单细胞RNA测序相关研究再发力
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CellRanger走起(四) Cell Ranger流程概览刘小泽写于19.5.7主要看流程，这一篇不涉及真实数据展示 总的来说，Cell Ranger主要的流程有：拆分数据 mkfastq、细胞定量 count、定量组合 aggr、...
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课程会在2019年9月底之前录制完毕并上线： 课程说明在：https://mp.weixin.qq.com/s/AV2uTbsvJGBRq_zv7yDmNg 所有代码在：https://github.com/jmzeng1314/scRNA_smart_seq2 观看链接 手机微信观看（推荐）：http://jm.grazy.cn/wechat/course/detail?cid=53 电脑浏览器的链接 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=53
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解析单细胞RNA-Seq Nature文章这是我听孟浩巍知乎Live：生信进阶第1课-重复Nature文章和B站视频：高通量测序技术交流录像里的笔记哦~ 目录：文章的主要结论解读传统RNA-Seq建库方法几种主要的单...
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【r<-基础|统计】频数检验
问题 你有分类数据然后想要检验是否这些数据值的频数分布是否与预期不符，或者是否组间的频数分布有（显著）差异。 方案 频数检验通常解决两类问题： 频数分布与预期或者理论的分布（...
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当你用setwd的时候，能考虑一下Rproject的感受吗
我在线下课程中讲过，R语言文件读取只有一个报错，就是： 传统的R语言书和课程里会讲，setwd（）这个命令是设置工作目录用的，所谓工作目录就是图片导出、脚本保存、数据读取的默...
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基因型填充之后如何过滤比如 个体分型率 < 90% 某一个样本测出来的标记小于全部标记的90% 标记分型率 < 90% 某一个标记只在小于90%的样本中存在 最小等位基因频率 < 0.05 这个一...
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楼主您好，想请教您一下，minQ是如何计算的，对应vcf文件的哪一个值？，我查看了vcf文件的每一项，感觉没有能对应上的，是否经过转换
关于SNP的过滤（1）：如何使用vcftools进行SNP过滤
前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言，说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的，确实这是一个比较重要的问题。第一，过滤到一些低质量的SNP可以防止calling一些假阳性...
