您好,想问一下,测序太久了公司找不到primer文件了是否能根据bam文件自己找出来呢,此外根据官方的24条primer-barcode序列组合,是不是可以参考网上标号一致的primer-barcode文件进行lima呢
PacBio数据拆分之lima一、背 景 PacBio最新三代测序仪Sequel II芯片实现了更高通路,同时已经支持barcode测序,这样方便混合多个组织、处理、物种等样本。 那么如何从poolin...
您好,想问一下,测序太久了公司找不到primer文件了是否能根据bam文件自己找出来呢,此外根据官方的24条primer-barcode序列组合,是不是可以参考网上标号一致的primer-barcode文件进行lima呢
PacBio数据拆分之lima一、背 景 PacBio最新三代测序仪Sequel II芯片实现了更高通路,同时已经支持barcode测序,这样方便混合多个组织、处理、物种等样本。 那么如何从poolin...
您好,想问一下多个下机数据但primer不同的情况下,可以在isoseq3 refine后再合并转录本吗
全长转录组分析-小麦前言 近期分析了一部分小麦的全长转录组数据,参考了网上许多流程,收获良多,在此记录一下 全长转录组测序基于PacBio单分子实时测序技术(SMRT cell),凭借超长读长的...
@笺牒九州的怪咖 谢谢
2019-07-29 【Pacbio三代转录组测序】拆分reads,CCS使用CCS: Generate Highly Accurate Single-Molecule Consensus Reads Latest ccs can be install...
想问一下subreads.bam文件有几十G,但处理产生的ccs.bam只有几百M,这个情况正常吗
把HiFi reads变成转录本文件这一次是主线任务,不过要简单许多。官方帮助:IsoSeq/isoseq-clustering.md at master · PacificBiosciences/IsoSeq...
想问一下subreads.bam文件有几十G,但处理产生的ccs.bam只有几百M,这个情况正常吗
2019-07-29 【Pacbio三代转录组测序】拆分reads,CCS使用CCS: Generate Highly Accurate Single-Molecule Consensus Reads Latest ccs can be install...
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