在我们涉足单细胞数据分析不久之后就会发现，我们在和一套新的理念打交道。在这套理念中，对象是常见的，数据是多维的，往往是一张核心表及其附属。我们对一张表是熟悉的，Excel极大...
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为什么要以数据库的思维来理解单细胞数据 -
R语言与python语言读写loom文件
最近越来越多的分析需要用到loom文件，其中主要是python的数据分析以及RNA速率分析的时候，格式之间的转化需要我们分析一下，这里分享给大家R及python对于loom文...
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TPM、RPKM与FPKM相互转换
RNA 数据下载后，如果处理成read counts matrix的话，是一定要进行基于基因长度的标准化的（TMP，RPKM，TPKM等）。目前最常用的是TPM，网上已经有很...
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关于DNA正负链的定义
关于DNA正负链的定义 转载 http://blog.sina.com.cn/s/blog_8de3399d0102ycf9.html2018-12-07 12:43:51 ...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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R中快速读取csv文件: read_csv对比fread
今天看到有人提问用readr::read_csv()读csv文件时把所有character型的变量读成factor型，HY大牛提供了一个方法用dplyr包的mutate_if...
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单细胞测序分析: Seurat 使用教程原文见Seurat - Guided Clustering Tutorial, Compiled: April 17, 2020 #1 Seurat安装 #2 数据下载 Pe...
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一条小咸鱼
