写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG Wang, Y Han, QY He. clusterPr...
请教潜哥这里只能使用ribo-seq测得的数据是么?
Ribo-seq分析必看文献 | 知识(五):RiboTaper之create_annotations_files.bash
当你处理NGS文本信息时,相信你不多不少也有遇到过类似的烦恼,例如不知道如何只提取gene ID的名字,或者只提取gff file中某一列的某一行,又或者想自己在每一行中添加...
基因组组装完成后,或者是完成了草图,就不可避免遇到一个问题,需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型,有三种策略: 从头注释(de novo prediction...
Ribo-seq分析综述Ribo-seq分析Ribo-seq分析必看文献 | 知识(一):15年玉米Ribo-seq分析必看文献 | 知识(二):19年植物综述之Polyso...
安装: conda install seqkit ref:seqkit一个FASTA/Q序列处理神器 - 遗世独立的愚公 - 博客园 一、序列操作: 1.取反向序列 seqk...
找到Matrix eQTL这个包,看下文章Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large matrix operations(...
本来下载数据用的是NCBI官方指定的sratool-kit里面带的prefetch,本来实验室网速快还没啥问题,但是这次碰到了一个硬茬,压缩后数据15G,下载数次中断,后来转...
归纳几篇eQTL相关文章。 1.转自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个...
VCF文件的变异分布图,除了使用Circos图之外,统计特定材料间的变异分布情况时可能会用到染色体分布图,为了节省时间,实现统计及绘图的自动化,现提供统计数量用的Python...
请问哪个包?没看到啊
桑基图怎么看怎么画(附R代码)什么是桑基图 桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,比较适用于用户流...
什么是桑基图 桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,比较适用于用户流...
您好,能看看这个数据的EXCEL表格长那样么~谢谢!
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比对软件很多,首先大家去收集一下,因为我们是带大家入门,请统一用hisat2(官网https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
转录组数据质量分析完,想拿kraken软件分析下数据有没有微生物的序列污染 找了全网没看见什么相关的指导文章,看官网的操作手册也很鸡助,所以自己翻译了官网手册以及写了代码,希...