IP属地：福建
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基因组重复序列检测：RepeatMasker的安装及使用RepeatMasker是重复序列检测的常用工具，通过与参考数据库的相似性比对来准确识别或屏蔽基因组中的重复序列，属于同源预测注释的方式。下文除了RepeatMasker的使...
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用TBtools，快速高效实现基因组共线性分析与可视化， 赞！写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴，可以通过以下几段内容，了解一下，我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
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研究生，常做实验，生信小白。
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总结各种生物科研工具使用经验
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公众号：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2读研，学习方向：癌症基因组、肿瘤免疫、单细胞组学
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Beast系统发育关系和分化时间的估算(上)以下内容参考了同研究组师弟整理的笔记、和网络资源：Beast v1.8简易手册-修订版 · 语雀 (yuque.com)[https://www.yuque.com/wush...
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一条小咸鱼
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用MrBayes构建系统发育树操作步骤整理总结
最近在学习构建进化树，尝试了用PHYML构建ML树和用MrBayes构建贝叶斯树，因为构建ML树时用的是网站的PHYML进行的，操作简便，所以就未做整理，只详细整理了一下贝叶...
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选择压力分析，从序列下载到结果绘图选择压力及基因在进化过程中所受到的压力，也称自然选择。 在遗传学中， Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频率(Ka)和同义突变频率（Ks）之间的比例。 一般认为，同义...
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mVISTA格式文件：由Perl脚本处理GenBank注释文件而来
Bioinformatic_Scripts/get_mVISTA_format_from_GenBank_annotation 1、简要说明 mVISTA是常用的叶绿体基因组...
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答读者问~使用R语言利用SSR数据构建进化树今天公众号的一位读者留言问有了SSR的数据，如何画树状图？ SSR的数据我也是第一次接触，我看了一下他发给我的数据，是csv格式，每行是一个样本，每列是一个位点。位点的取值是...
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随笔记录，方便查找；<br>欢迎扫码交流
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植物分类学网站推荐
本文章意在列举一些植物分类学研究过程中常用的互联网在线资源。 1. 植物志 1.1 国内植物志 中国植物志[http://frps.iplant.cn/] Flora of ...
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系统发育树构建简明教程1. 前言 构建一棵系统发育树是研究系统学和进化的基础。然而，发育树的构建是对分类单元进化历史的推测，因此对发育树的可靠性检验也是重中之重。一棵发育树的获得大致分为数据输入、...
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Take care of yourself and be well!
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计算RSCU值并绘图1.计算RSCU值 可以直接用pip安装CAI 自己写个RSCU.py计算RSCU值，当然你也可以通过在线版EMBOSS[http://www.bioinformatics....
