发简信
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单细胞36计
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啊，那个harmony要设置为defaultassay吗？
单细胞分析实录(6): 去除批次效应/整合数据
上一篇已经讲解了Seurat标准流程，推文的最后，注意到了不同样本之间的表达数据是存在批次效应的，就像下图这样，有些是可以聚到一起的亚群，却出现了不同样本分开/偏移的情况，比...
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整合数据完后续做scale、聚类过程，要设置defaultassay为整合数据吗？还是默认的RNA就好呢？
单细胞分析实录(6): 去除批次效应/整合数据
上一篇已经讲解了Seurat标准流程，推文的最后，注意到了不同样本之间的表达数据是存在批次效应的，就像下图这样，有些是可以聚到一起的亚群，却出现了不同样本分开/偏移的情况，比...
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@追风少年i 那单独的肿瘤样本聚类会把肿瘤细胞聚成一类吗？还是之前qc的时候就把大部分肿瘤细胞过滤掉了？
10X单细胞（10X空间转录组）数据分析之识别肿瘤细胞的CNV分析原理
hello，大家好，今天我们来总结单细胞数据识别肿瘤细胞的分析原理。其中单细胞识别肿瘤细胞最大的问题在于，reference，什么细胞作为reference，上皮细胞癌变，自...
