wangyantao1991

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2021-11-23集群安装R包GOstats
安装R包GOstats，出现以下错误： ERROR: dependency ‘httr’ is not available for packag...

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2021-08-04：GO富集网络可视化工具
利用Cytoscape上的插件可以实现GO 分析的网络化，不过非模式植物会很麻烦：具体参考了简书的以下内容： Bingo(Cytoscape插件...

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2021-07-09：细数我在GO注释时遇到的那些报错
上回说到，我废了九牛二虎之力，终于拿到了百十来个GB的GO EVIDENCE 数据，你猜怎么着，接着往下进行的时候发现，R语言根本读不了。。。。...

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2021-07-04--GO富集之马铃薯的EVIDENCE不好搞
一连试了几天用集群的R构建EVIDENCE,结果并不能让我满意，基本上一天只能跑一个，再运行第二个的时候就会报错。尝试到现在就只剩下马铃薯的还未...

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2021-07-01
昨天忙着做实验，没时间鼓捣数据，今天也得做实验，不过在试验开始之前还是先整理一下吧：首先是安装R包尝试本地运行后发现，报错：本地内存太小，...

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2021-06-29：Go注释的相关操作记录
主要参考：(4条消息) 无参转录组GO、KEGG富集分析——diamond+idmapping+GOstats_ygyxl的博客-CSDN博客[...

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Linux集群中安装miniconda2
主要参考：conda管理生信软件一文就够 (qq.com)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxO...

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2021-06-28 Rstdio中DESeq2相关软件的安装
#首先升级R install.packages("installr") library(installr) updateR() library(...

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2021-06-27--致病疫霉的差异基因表达分析
在Rstdio软件里使用DESeq2进行致病疫霉及茄科植物的差异基因表达分析，茄科植物由于隶属不同物种，各个基因有所差异，故优先进行纵向比较，即...

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