发简信
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转录组分析中的免疫浸润的评估方法注：本文仅讨论转录组数据中的免疫浸润评估。关于免疫浸润的计算，其实有不少综述进行过总结。笔者看到过2篇发表于2018年的相关综述（虽然现在都20...
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生信知识补充目前研究转录组的方法主要三种：（1）基于杂交技术的cDNA芯片和寡聚核苷酸芯片；（2）基于sanger测序法的SAGE (serial anal...
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文献阅读专题
第1篇 原文：Integrative analysis of gene expression and DNA methylation throu...
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跳出套路的生信分析第1篇 原文：High-dimensional single-cell analysis predicts response to anti-P...
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常用模型使用简介
XGBoost xgboost入门与实战（原理篇）的后半部分介绍了需要注意的参数和基本使用方法。神器xgboost简单入门和运用手把手教写出XG...
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非编码RNA生信分析第1篇 发在Journal of Translational Medicine（4分）。原文：Circular RNA regulatory n...
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甲基化套路和甲基化有关的。可以先了解下甲基化：450k甲基化基础450K甲基化芯片数据处理传送门450k甲基化芯片常用工具包：ChAMP和minfi等。 ...
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生信数据库
最常使用的数据库是TCGA和GEO，网上有一些不错的博客介绍了如何使用这两个数据库，本文不再赘述，直接贴链接吧。 TCGA数据库：TCGA-GD...
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生信实战通道
笔者先前沉迷于算法原理研究，科研转化效率低下。痛定思痛，新开启简书账号，记录生信实战套路。本系列不纠结于算法原理，纯粹功利实战，套路优先。专注于...