肿瘤微环境是近年来的研究热点。复杂而动态的微环境中，肿瘤细胞与浸润性免疫细胞、基质细胞等相互作用，这在促进或抑制肿瘤生长、侵袭、转移以及对病人临床预后方面可能具有多方面的影响...
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表达谱分析组织中细胞组分情况 --- CIBERSORT & xCell -
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要去很远的地方
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TCGA转录组数据及临床数据下载及整理一、TCGA转录组数据下载及整理 ①进去先看cart是否为空，没有要清空。 ②下载转录组数据 基因表达量包括LncRNA和mRNA，用矫正后的FPKM下载3个文件 ③下载数据...
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Stay Hungry. Stay Foolish<br>学点R语言，搞点数据挖掘<br>专注肿瘤研究和学习<br>ORCID:<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Forcid.org%2F0000-0002-0660-7802" target="_blank">https://orcid.org/0000-0002-0660-7802</a><br>CSDN：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fblog.csdn.net%2Flijianpeng0302%3Ftype%3Dblog" target="_blank">https://blog.csdn.net/lijianpeng0302?type=blog</a> 生信小鹏
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从TCGA数据库下载并整合清洗高通量肿瘤表达谱-临床性状数据测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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跟着 Cell 学作图 | 5.UMAP降维分析跟着 Cell 学作图 | 5.UMAP降维分析 “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最好办法。” DOI: 10.1016/j.cell.2020.05.03...
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量化免疫浸润时CIBERSORT的注意事项CIBERSORT的注意事项 CIBERSORT的使用，我们举了几个例子，但是还有一些疑问，只要有疑问在，就感觉心里不踏实。比如：1.CIBERSORT需要什么样的数据？是芯...
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爱一个女孩子，<br>与其为了她的幸福而放弃她，<br>不如留住她，<br>为她的幸福而努力。<br>如果要为了她的幸福而放弃她，<br>不如不要让她知道你那份不够深的爱！<br><br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fxindot.com%2F" target="_blank">https://xindot.com/</a>
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