有一点不对,expand=c(0.1,0.2),应该表示向上下扩展10%,向上下+0.2,
9. ggplot2中expand参数我们似乎没有担心过数据点被画到axes之外,这是因为ggplot2会在data range和axes之间加一些padding,以保证数据和坐标轴不会重叠: 来自scale...
有一点不对,expand=c(0.1,0.2),应该表示向上下扩展10%,向上下+0.2,
9. ggplot2中expand参数我们似乎没有担心过数据点被画到axes之外,这是因为ggplot2会在data range和axes之间加一些padding,以保证数据和坐标轴不会重叠: 来自scale...
gzip 使用deflate算法进行压缩。gzip 对于要压缩的文件,首先使用LZ77算法的一个变种进行压缩,对得到的结果再使用Huffman编码的方法 LZ77算法的压缩原...
楼主的那个问题我觉得可能是因为前面加载过包,这些依赖也被加载了,在windows系统这些文件是只读模式,重启下R/Rstudio可能会好。我觉得你的应该也是这种问题
R坑二:Warning: cannot remove prior installation of package ‘digest’安装TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene包,报错... 提示没有包digest没有,安装... 提示Warning: cannot remove...
安装TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene包,报错... 提示没有包digest没有,安装... 提示Warning: cannot remove...
疑问: 当我想要通过VCF文件查看一个突变位点的变异reads支持数时,发现文件展示的DP (total depth) 和AD (allele depth)的数量对应不上是咋...
通用式的修改方式: 也可以指定: 如果列比较多,也可以考虑全部重命名: 参考:how-to-rename-a-single-column-in-a-data-framecha...
最近在做WES数据分析,后期需要检测样本CNV的结果,于是看到cnvnator这个软件,导致我未来的一周在坑中度过,翻看别人写的博文,不懂(什么啊一个都走不通)--不断尝试-...
多点取样的WES看肿瘤内部异质性文章合辑 肿瘤内部异质性问题已经是老生常谈了,在NGS如日中天的这些年,已经有非常多的多位点取样进行WES测序探索肿瘤异质性的(不同癌症研究的...
请问gz压缩是不是按行压缩?每一行的数据都可以单独拿出来解读?
深入理解gzip原理gzip 使用deflate算法进行压缩。gzip 对于要压缩的文件,首先使用LZ77算法的一个变种进行压缩,对得到的结果再使用Huffman编码的方法 LZ77算法的压缩原...
安装所需要的R包 加载所需的R包,并将默认主题设置为theme_bw(),并将图例放在图的顶部 创建一些基本图像: patchwork包水平拼接 垂直布局可以通过向plot_...
28. 瀑布图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用waterfalls包绘制瀑布图 使用maftools包绘制瀑布图 使用GenVisR包绘制瀑布图
自从开始学习R语言,read.table是较早接触到的函数,因为要读取数据,也因为最开始学习数据分析是用“制表分隔符的txt”文件比较多,xlsm在linux系统中又不太合适...
上游数据示例: 基因A 结果示例: 基因B 两幅图组合在一起 示例: 累积柱状图 示例: 柱状图渐变色 柱状图上标数字 普通柱状图 上游数据 示例图
============================================写在前面:可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做?[https://www.jians...
写在前面的废话 注释文件的格式已经被各种教程讲烂了,那我肯定不能这么俗套。所以咱们今天只谈风花雪月,不讲具体格式…… 搞NGS,注释文件是我们经常需要用到的。但是不同的实验室...
你在用R读取数据时,是否曾出现过这样的错误Warning messages:1: In scan(file = file, what = what, sep = sep, q...
germline 的除了GATK还有啥呢
SNV分析软件/工具(持续更新中...)体细胞SNV Calling 的文献:A review of somatic single nucleotide variant calling algorithms for...
体细胞SNV Calling 的文献:A review of somatic single nucleotide variant calling algorithms for...
一、什么是中心极限定理 在适当的条件下,大量相互独立随机变量的均值经适当标准化后依分布收敛于正态分布。每次从这些总体中随机抽取 n 个抽样,一共抽 m 次。 然后把这 m 组...
centos的呢。。
ubuntu下python2完全卸载1.卸载python2.7 sudo apt-get remove python2.7 2.卸载python2.7及其依赖 sudo apt-get remove --aut...