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    群体适应性分析——选择信号

    ●选择信号:生物在自然选择或人工选择过程中,由于选择作用在基因组上留下的遗传多态性降低、连锁不平衡等选择印记。●选择性清除(selective sweep):受选择基因座位的...

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    群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全

    基因流(也称基因迁移)是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因,是遗传变异一个非常重要的来源,...

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    StringTie + DESeq2 进行 RNA-seq 差异基因分析

    按:RNA-seq 流程非常多样化,每一个步骤可选工具都非常多。我的选择是 StringTie 进行组装取得 read counts 数值,DESeq2 分析差异基因。这里把...

  • 如何构建SNPs-based phylogenetic tree

    如果根据SNP或者Indel 构建其系统进化树,可以展示群体中不同个体的相互关系,基因变异相似的往往会在同一个树的cluster中,一颗好的树可以给你一个群体大概的分类(你这...

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    可重复的生信分析系列一:Docker的介绍

    可重复的生信分析一直是未来的趋势。如果实现可重复的生信分析,关键在于分析软件版本的控制,一致的环境设置还有良好的分析流程的记录。最近发现一篇关于这方面很好的教程。改教程主要分...