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接到一个非标准格式保存的fasta序列格式的文本,看起来像是直接从NCBI copy下来的。内含多条序列,后续需要对序列进行对位排列,而手工改不...
问题1:使用snippy用于fasta序列的文件SNP calling。发现结果中core.full.aln中,有开头100bp和结尾的100b...
处理序列时,有很多时候会调入换行符的坑!!!!! 在Windows下的Editplus使用\r\n等查看换行符很诡异,有的时候会出现\n\r的情...
1. 反向引用: 举例 \1 匹配的第一个(.) \2 匹配的第二个(.)**这个正则表达式的意思是匹配y后面的两个任意字符,再将这两个字符倒过...
1. Shell 脚本中取两个数的百分比 2. perl 脚本中取两个数的百分比
sort在文本排序方面很是强悍。但有时不是单列进行排序,需要按照不同的列进行排序。 1. sort -t $'\t' -k2nr file.cs...
sed 的全称为 “Stream Editor” ,字符流编辑程序 1. sed -i '$s/$/\n/' homo1.fa $ 第一个$代表...
使用python 的pandas模块时总是报错 $ pip show pandasWARNING: Package(s) not found: ...
在Linux上执行命令有的时候需要放到后台运行,此文主要讲放入后台和查看后台任务的方法 一、放入后台命令 1. 命令 空格 & 直接将命令放入后...